RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580654.5

SMARCE1-217, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 MAP7D3Q8IWC1 876 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC22A15Q8IZD6 547 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 CSNK1A1LQ8N752 337 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 OR9A4Q8NGU2 314 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 KIAA1191Q96A73 305 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 OR2A5Q96R48 311 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 SMC6Q96SB8 1091 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 APOL2Q9BQE5 337 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 DRC3Q9H069 523 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 B4GALT7Q9UBV7 327 aa7.16□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 NOTCH1P46531 2555 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 A0A0G2JMM0 328 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 A0A1B0GVC2 190 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 A0A1W2PPB8 328 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 A0A1W2PRS3 328 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 OR14I1A6ND48 311 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM166BA8MTA8 275 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 LGALS16A8MUM7 142 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 KIR3DP1A8MWS1 328 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 BCKDKO14874 412 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 GOSR1O95249 250 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 IGHG3P01860 377 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 CYP1A2P05177 515 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 BMP5P22003 454 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 ADRA1AP35348 466 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 AGTR2P50052 363 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 TAS2R50P59544 299 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 PPIAP62937 165 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 RHAGQ02094 409 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 RUNX1T1Q06455 604 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 CATSPEREQ5SY80 951 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 MFSD4BQ5TF39 518 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 GARNL3Q5VVW2 1013 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 PAOXQ6QHF9 649 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 HIPK1Q86Z02 1210 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF567Q8N184 647 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 CFAP61Q8NHU2 1237 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 CREB3L4Q8TEY5 395 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 TSLPQ969D9 159 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 PERPQ96FX8 193 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 SPATA13Q96N96 652 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 LPAR4Q99677 370 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 DPH7Q9BTV6 452 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF487B1APH4 448 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 H7C0S8 307 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 MYO1FO00160 1098 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 APOL1O14791 398 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 DSCAMO60469 2012 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 WDR1O75083 606 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 DNAJB6O75190 326 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 GPC4O75487 556 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 GLSO94925 669 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 FTH1P02794 183 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 STATHP02808 62 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 CELA3AP09093 270 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 SKILP12757 684 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 CCR7P32248 378 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 XCR1P46094 333 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 UBXN1Q04323 297 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 PTK6Q13882 451 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM53BQ14153 422 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 TYSND1Q2T9J0 566 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 SYTL3Q4VX76 610 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 TRILQ7L0X0 811 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 TAS2R42Q7RTR8 314 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 PCGF5Q86SE9 256 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 HEATR5AQ86XA9 2040 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 PLPP5Q8NEB5 264 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 OR51Q1Q8NH59 317 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 HMGCLL1Q8TB92 370 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 C19orf43Q9BQ61 176 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 FSD1LQ9BXM9 530 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 TTTY12Q9BZ98 90 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 LANCL2Q9NS86 450 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 AIPL1Q9NZN9 384 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 HCN3Q9P1Z3 774 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC39A10Q9ULF5 831 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 MYO6Q9UM54 1294 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-217ENST00000580654 A0A087X1B8 175 aa7.13□□□□□ -1.27
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