RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 AURKAO14965 403 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRM-211ENST00000580170 KMOO15229 486 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRM-211ENST00000580170 KDELR3O43731 214 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRM-211ENST00000580170 CCL14Q16627 93 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRM-211ENST00000580170 SPANXN4Q5MJ08 99 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRM-211ENST00000580170 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
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PTPRM-211ENST00000580170 HCN3Q9P1Z3 774 aa20.72■□□□□ 0.91
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PTPRM-211ENST00000580170 AUTS2Q8WXX7 1259 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRM-211ENST00000580170 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
PTPRM-211ENST00000580170 EDARQ9UNE0 448 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRM-211ENST00000580170 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
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