RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
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CTDNEP1-202ENST00000570380 FEZF1A0PJY2 475 aa9.75□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 PINLYPA6NC86 204 aa9.75□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 FIGNL2A6NMB9 653 aa9.75□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 F8W8V4 182 aa9.75□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 SGK494L7N484 410 aa9.75□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
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CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM253P0C7T8 217 aa9.75□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 PKMP14618 531 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
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CTDNEP1-202ENST00000570380 SEMA3AQ14563 771 aa9.75□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 NR1I3Q14994 352 aa9.75□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.853e-7■□□□□ 10.6
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CTDNEP1-202ENST00000570380 KCTD11Q693B1 232 aa9.75□□□□□ -0.85
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CTDNEP1-202ENST00000570380 PLD3Q8IV08 490 aa9.75□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 PHC2Q8IXK0 858 aa9.75□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa9.75□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 VWA5B2Q8N398 1253 aa9.75□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 SIMC1Q8NDZ2 872 aa9.75□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 TSSK1BQ9BXA7 367 aa9.75□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 LANCL2Q9NS86 450 aa9.75□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 DEPPQ9NTK1 212 aa9.75□□□□□ -0.85
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CTDNEP1-202ENST00000570380 OR14I1A6ND48 311 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 RNF212BA8MTL3 300 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 MAGEB17A8MXT2 336 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 BCKDKO14874 412 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 HAT1O14929 419 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC16A5O15375 505 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 ARHGEF9O43307 516 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 GOT2P00505 430 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 ERGP11308 486 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 IL1RNP18510 177 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 COMTP21964 271 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 TACR1P25103 407 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
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CTDNEP1-202ENST00000570380 ZBED6P86452 979 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMED2Q15363 201 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 TYSND1Q2T9J0 566 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 CCDC38Q502W7 563 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q5PR19 223 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 ICE2Q659A1 982 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR13J1Q8NGT2 312 aa9.74□□□□□ -0.85
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CTDNEP1-202ENST00000570380 CREB3L4Q8TEY5 395 aa9.74□□□□□ -0.85
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CTDNEP1-202ENST00000570380 ALS2CR12Q96Q35 445 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 SMC6Q96SB8 1091 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 SH3GL2Q99962 352 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 MACROD1Q9BQ69 325 aa9.74□□□□□ -0.85
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CTDNEP1-202ENST00000570380 ATG10Q9H0Y0 220 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa9.74□□□□□ -0.85
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CTDNEP1-202ENST00000570380 TRPS1Q9UHF7 1281 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 LIPGQ9Y5X9 500 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 MRFAP1Q9Y605 127 aa9.74□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 DUSP10Q9Y6W6 482 aa9.74□□□□□ -0.85
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CTDNEP1-202ENST00000570380 FAM166BA8MTA8 275 aa9.73□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa9.73□□□□□ -0.85
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CTDNEP1-202ENST00000570380 RDH16O75452 317 aa9.73□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 APOC2P02655 101 aa9.73□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 EPXP11678 715 aa9.73□□□□□ -0.85
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CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC1A1P43005 524 aa9.73□□□□□ -0.85
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CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC18A3Q16572 532 aa9.73□□□□□ -0.85
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CTDNEP1-202ENST00000570380 C1orf185Q5T7R7 199 aa9.73□□□□□ -0.85
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CTDNEP1-202ENST00000570380 GSDMBQ8TAX9 411 aa9.73□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 MAGEC3Q8TD91 643 aa9.73□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 SMPDL3AQ92484 453 aa9.73□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 PEX11GQ96HA9 241 aa9.73□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q96MF0 132 aa9.73□□□□□ -0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 TTC1Q99614 292 aa9.73□□□□□ -0.85
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