RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570103.5

CFDP1-209, Transcript of craniofacial development protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CFDP1, Length 663 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1-209ENST00000570103 CBSP35520 551 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 ST8SIA6P61647 398 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 COG7P83436 770 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 RUNX2Q13950 521 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 HSPB2Q16082 182 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 GSTA3Q16772 222 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 ALG11Q2TAA5 492 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 MPPE1Q53F39 396 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 ZNF542PQ5EBM4 170 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 C9orf64Q5T6V5 341 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 ATG9BQ674R7 924 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 TTI2Q6NXR4 508 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 PAQR9Q6ZVX9 377 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 FAM217AQ8IXS0 508 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 FAM185AQ8N0U4 392 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 C4orf32Q8N8J7 132 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 TMEM116Q8NCL8 245 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 NAT6Q93015 286 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 ZBTB9Q96C00 473 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
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CFDP1-209ENST00000570103 FIZ1Q96SL8 496 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 FAM213AQ9BRX8 229 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 MED10Q9BTT4 135 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 CALN1Q9BXU9 219 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 B3GNT4Q9C0J1 378 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 PRSS22Q9GZN4 317 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 NMUR1Q9HB89 426 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 PARVGQ9HBI0 331 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 HAUS2Q9NVX0 235 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 RASAL2Q9UJF2 1139 aa4.6□□□□□ -1.67
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CFDP1-209ENST00000570103 LOXL2Q9Y4K0 774 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 SEC16AO15027 2179 aa4.6□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 LRRC53A6NM62 1247 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 D6RAR5 112 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 STMND1H3BQB6 276 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
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CFDP1-209ENST00000570103 PRR35P0CG20 571 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 SPTBP11277 2137 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 ACANP16112 2415 aa4.59□□□□□ -1.67
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CFDP1-209ENST00000570103 CD70P32970 193 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 TTKP33981 857 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 RYKP34925 604 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 HADHAP40939 763 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 ETV5P41161 510 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 CENPAP49450 140 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 ZNF131P52739 623 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 HDAC4P56524 1084 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 MAP3K7CLP57077 242 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 GTF3C1Q12789 2109 aa4.59□□□□□ -1.67
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CFDP1-209ENST00000570103 DEFB133Q30KQ1 61 aa4.59□□□□□ -1.67
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CFDP1-209ENST00000570103 TBC1D26Q86UD7 250 aa4.59□□□□□ -1.67
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CFDP1-209ENST00000570103 TTC39CQ8N584 583 aa4.59□□□□□ -1.67
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CFDP1-209ENST00000570103 KDM1BQ8NB78 822 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 OR5B17Q8NGF7 314 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 WFDC5Q8TCV5 224 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 SMARCE1Q969G3 411 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 FAM131CQ96AQ9 280 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 TMEM159Q96B96 161 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa4.59□□□□□ -1.67
CFDP1-209ENST00000570103 PLIN2Q99541 437 aa4.59□□□□□ -1.67
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