RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568936.1

CCNDBP1-214, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-214ENST00000568936 CLDN8P56748 225 aa11.13□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 KCNK10P57789 538 aa11.13□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 BNC1Q01954 994 aa11.13□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa11.13□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 CACHD1Q5VU97 1274 aa11.13□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa11.13□□□□□ -0.63
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CCNDBP1-214ENST00000568936 FAM156AQ8NDB6 213 aa11.13□□□□□ -0.63
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CCNDBP1-214ENST00000568936 OR2A14Q96R47 310 aa11.13□□□□□ -0.63
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CCNDBP1-214ENST00000568936 AIF1LQ9BQI0 150 aa11.13□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 IER2Q9BTL4 223 aa11.13□□□□□ -0.63
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CCNDBP1-214ENST00000568936 DPY30Q9C005 99 aa11.13□□□□□ -0.63
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CCNDBP1-214ENST00000568936 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 UCKL1Q9NWZ5 548 aa11.13□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 OR6C2Q9NZP2 312 aa11.13□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
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CCNDBP1-214ENST00000568936 OR6C74A6NCV1 312 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 ANGPT2O15123 496 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 PPM1DO15297 605 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 YY2O15391 372 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 OR1F1O43749 312 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 GPR37L1O60883 481 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 VIPP01282 170 aa11.12□□□□□ -0.63
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CCNDBP1-214ENST00000568936 LSSP48449 732 aa11.12□□□□□ -0.63
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CCNDBP1-214ENST00000568936 PLIN5Q00G26 463 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 ACSM2AQ08AH3 577 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 PLCL1Q15111 1095 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 ACSM2BQ68CK6 577 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 ZNF425Q6IV72 752 aa11.12□□□□□ -0.63
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CCNDBP1-214ENST00000568936 TMEM126BQ8IUX1 230 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 KRT78Q8N1N4 520 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 TMEM105Q8N8V8 129 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 LMX1AQ8TE12 382 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 TSPEARQ8WU66 669 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 ROPN1LQ96C74 230 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 ASB9Q96DX5 294 aa11.12□□□□□ -0.63
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CCNDBP1-214ENST00000568936 TMED5Q9Y3A6 229 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 PCDH15Q96QU1 1955 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 MYO15AQ9UKN7 3530 aa11.12□□□□□ -0.63
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CCNDBP1-214ENST00000568936 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 AKAP10O43572 662 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 PEX1O43933 1283 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 PRAMEF10O60809 474 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 PRPS2P11908 318 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 MS4A2Q01362 244 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 UGT8Q16880 541 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 DLEU7Q6UYE1 221 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 COMMD6Q7Z4G1 85 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 ZNF438Q7Z4V0 828 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 PDSS2Q86YH6 399 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 TRIM48Q8IWZ4 208 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 HOMEZQ8IX15 550 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 KIAA2013Q8IYS2 634 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 PQLC1Q8N2U9 271 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 OR10G6Q8NH81 332 aa11.12□□□□□ -0.63
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CCNDBP1-214ENST00000568936 F2RL3Q96RI0 385 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 NT5DC2Q9H857 520 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 LHX9Q9NQ69 397 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 SLC6A13Q9NSD5 602 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 POT1Q9NUX5 634 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 TMEM45AQ9NWC5 275 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 ERVK-11Q9UQG0 969 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 DMDP11532 3685 aa11.11□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa11.11□□□□□ -0.63
CCNDBP1-214ENST00000568936 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa11.11□□□□□ -0.63
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