RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 VILLO15195 856 aa8.21□□□□□ -1.09
PDPR-210ENST00000568530 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
PDPR-210ENST00000568530 POP4O95707 220 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PDPR-210ENST00000568530 CD2P06729 351 aa8.21□□□□□ -1.09
PDPR-210ENST00000568530 ZNF12P17014 697 aa8.21□□□□□ -1.09
PDPR-210ENST00000568530 JUNDP17535 347 aa8.21□□□□□ -1.09
PDPR-210ENST00000568530 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PDPR-210ENST00000568530 GCH1P30793 250 aa8.21□□□□□ -1.09
PDPR-210ENST00000568530 GRM5P41594 1212 aa8.21□□□□□ -1.09
PDPR-210ENST00000568530 CCR3P51677 355 aa8.21□□□□□ -1.09
PDPR-210ENST00000568530 KCNC4Q03721 635 aa8.21□□□□□ -1.09
PDPR-210ENST00000568530 TMEM192Q8IY95 271 aa8.21□□□□□ -1.09
PDPR-210ENST00000568530 CCDC36Q8IYA8 594 aa8.21□□□□□ -1.09
PDPR-210ENST00000568530 C4orf32Q8N8J7 132 aa8.21□□□□□ -1.09
PDPR-210ENST00000568530 ACDQ96AP0 544 aa8.21□□□□□ -1.09
PDPR-210ENST00000568530 MFRPQ9BY79 579 aa8.21□□□□□ -1.09
PDPR-210ENST00000568530 DUSP16Q9BY84 665 aa8.21□□□□□ -1.09
PDPR-210ENST00000568530 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
PDPR-210ENST00000568530 PLLPQ9Y342 182 aa8.21□□□□□ -1.09
PDPR-210ENST00000568530 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa8.21□□□□□ -1.09
PDPR-210ENST00000568530 PHLPP1O60346 1717 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 SLC1A7O00341 560 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 AZIN1O14977 448 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 IFNA21P01568 189 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 RAC2P15153 192 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 CD72P21854 359 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 AQP4P55087 323 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 DECR1Q16698 335 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 AARDQ4LEZ3 155 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 SERPINA9Q86WD7 417 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 IL17RCQ8NAC3 791 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 OR4D6Q8NGJ1 314 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 TPPP3Q9BW30 176 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 TREM1Q9NP99 234 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 TRPV5Q9NQA5 729 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 DECR2Q9NUI1 292 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 TVP23BQ9NYZ1 205 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 GPRC5BQ9NZH0 403 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 KLHL42Q9P2K6 505 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 H3BML4 177 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 LSM1O15116 133 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 ITM2AO43736 263 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 TACR2P21452 398 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 MPIP34949 423 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 BDKRB1P46663 353 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 ZNF84P51523 738 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 CLCN5P51795 746 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 TRIM61Q5EBN2 209 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 GMLQ99445 158 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 GCM1Q9NP62 436 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 HMGXB4Q9UGU5 601 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 A0A0G2JPF8 293 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 OR51F1A6NGY5 319 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 ANKRD28O15084 1053 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 PAHP00439 452 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 BPGMP07738 259 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 ZNF3P17036 446 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 GRPRP30550 384 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 CHRNA4P43681 627 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 CDH12P55289 794 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 XIAPP98170 497 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 FOXC1Q12948 553 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 MON1BQ7L1V2 547 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 TMEM17Q86X19 198 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 DBF4BQ8NFT6 615 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 CDH20Q9HBT6 801 aa8.21□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa8.2□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 DAPL1A0PJW8 107 aa8.2□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 TTLL8A6PVC2 850 aa8.2□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 B8ZZF3 427 aa8.2□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 TNFRSF11BO00300 401 aa8.2□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 PRAMEF10O60809 474 aa8.2□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 CCR8P51685 355 aa8.2□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 OR4D2P58180 307 aa8.2□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 RAB8AP61006 207 aa8.2□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 PTPRCAPQ14761 206 aa8.2□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 MFSD13AQ14CX5 517 aa8.2□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 TIGD2Q4W5G0 525 aa8.2□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa8.2□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 MIOSQ9NXC5 875 aa8.2□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 B3GNT2Q9NY97 397 aa8.2□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PDPR-210ENST00000568530 TAC3Q9UHF0 121 aa8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms