RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 BTBD16Q32M84 506 aa6.79□□□□□ -1.32
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CCNDBP1-212ENST00000567690 TAS2R13Q9NYV9 303 aa6.78□□□□□ -1.32
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.78□□□□□ -1.32
CCNDBP1-212ENST00000567690 IKZF3Q9UKT9 509 aa6.78□□□□□ -1.32
CCNDBP1-212ENST00000567690 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa6.78□□□□□ -1.32
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CCNDBP1-212ENST00000567690 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR1F1O43749 312 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAN1A2O60476 641 aa6.77□□□□□ -1.33
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