RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566336.5

NAE1-215, Transcript of NEDD8 activating enzyme E1 subunit 1, human

TSL 5

Gene NAE1, Length 686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NAE1-215	ENST00000566336	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	IL17A	Q16552	155 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	PGS1	Q32NB8	556 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	GXYLT1	Q4G148	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	EMC4	Q5J8M3	183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	CNST	Q6PJW8	725 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	LRRC31	Q6UY01	552 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	DPPA4	Q7L190	304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336		Q8N1Y9	231 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	RAD54L	Q92698	747 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	SNX21	Q969T3	373 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	SCMH1	Q96GD3	660 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	HES7	Q9BYE0	225 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	MIS12	Q9H081	205 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	ZWILCH	Q9H900	591 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	WDR54	Q9H977	334 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	COX16	Q9P0S2	106 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	RYR2	Q92736	4967 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336		A0A1W2PPH5	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	OR5K3	A6NET4	321 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	GSTA4	O15217	222 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	FRS3	O43559	492 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	PALM	O75781	387 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	ONECUT2	O95948	504 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	SERPINC1	P01008	464 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	IGLV3-25	P01717	112 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	OSM	P13725	252 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	ATP6V1B1	P15313	513 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	BMP5	P22003	454 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	CYP2J2	P51589	502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	ITGA8	P53708	1063 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	RHOA	P61586	193 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	VLDLR	P98155	873 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	COL10A1	Q03692	680 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	LSAMP	Q13449	338 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	MESD	Q14696	234 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	OR1C1	Q15619	314 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	HSPB2	Q16082	182 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	SPINK14	Q6IE38	97 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	FAM166A	Q6J272	317 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NAE1-215	ENST00000566336	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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