RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557654.5

GPHN-215, Transcript of gephyrin, human

TSL 4

Gene GPHN, Length 503 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPHN-215	ENST00000557654	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	OR1L3	Q8NH93	324 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	PRAM1	Q96QH2	718 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	SEPHS2	Q99611	448 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	APOL6	Q9BWW8	343 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	FUT8	Q9BYC5	575 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	FAM107B	Q9H098	131 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	CFAP45	Q9UL16	551 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	USP16	Q9Y5T5	823 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	TCHH	Q07283	1943 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	ZSCAN12	O43309	604 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	PI15	O43692	258 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	GLRA3	O75311	464 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	LINGO3	P0C6S8	592 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	CYP11B2	P19099	503 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	LHCGR	P22888	699 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	CD27	P26842	260 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	NNMT	P40261	264 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	HNF4A	P41235	474 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	MTHFR	P42898	656 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	CCR10	P46092	362 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	EVC	P57679	992 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	PRKG2	Q13237	762 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	LETM2	Q2VYF4	491 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	G2E3	Q7L622	706 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	LGI2	Q8N0V4	545 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	MNS1	Q8NEH6	495 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	ZNF519	Q8TB69	540 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	FAM222B	Q8WU58	562 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	OMA1	Q96E52	524 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	LRRC37A3	O60309	1634 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	ABCC6	O95255	1503 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	ALK	Q9UM73	1620 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	EPHB6	O15197	1021 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	SMC2	O95347	1197 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	ACSL3	O95573	720 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	STARD3NL	O95772	234 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	PTGER4	P35408	488 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	UBXN2A	P68543	259 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	VEZF1	Q14119	521 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	TICAM2	Q86XR7	235 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	NECAB1	Q8N987	351 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		4.18	□□□□□ -1.74
GPHN-215	ENST00000557654	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74

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