RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 PCK1P35558 622 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ZXDBP98169 803 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 TUBB2AQ13885 445 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 DHCR24Q15392 516 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 SMU1Q2TAY7 513 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 CNPY1Q3B7I2 92 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 PITRM1Q5JRX3 1037 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 SDHAF4Q5VUM1 108 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 WSCD1Q658N2 575 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 JADE1Q6IE81 842 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 Q6YL49 198 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 RFX8Q6ZV50 586 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 TAS2R42Q7RTR8 314 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 PEX26Q7Z412 305 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 CPLX4Q7Z7G2 160 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 GLRX5Q86SX6 157 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 METTL23Q86XA0 190 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 NAXDQ8IW45 347 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 BBS7Q8IWZ6 715 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 THEM5Q8N1Q8 247 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 TERB1Q8NA31 727 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 BBS1Q8NFJ9 593 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 PYROXD1Q8WU10 500 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 KCTD4Q8WVF5 259 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 HMGB4Q8WW32 186 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 VPS33AQ96AX1 596 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 TUBB2BQ9BVA1 445 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 SLC26A1Q9H2B4 701 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 LRMDAQ9H2I8 198 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 PCDH9Q9HC56 1237 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 TREM1Q9NP99 234 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 AKIP1Q9NQ31 210 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 SNTG1Q9NSN8 517 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 PARVAQ9NVD7 372 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 EXD2Q9NVH0 621 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 GRHPRQ9UBQ7 328 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 DKK2Q9UBU2 259 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 PCDHA7Q9UN72 937 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 PTPN13Q12923 2485 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 A0A087WV48 116 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 GAGE12BA1L429 117 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ZNF98A6NK75 572 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 CYB561D2O14569 222 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 GABRDO14764 452 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 FAM228BP0C875 321 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 CNTFP26441 200 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 GP5P40197 560 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 SPCS3P61009 180 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 GLO1Q04760 184 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ZNF33AQ06730 810 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 C17orf67Q0P5P2 114 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 TRAF2Q12933 501 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 NAB1Q13506 487 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 EFR3AQ14156 821 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 TMEM132DQ14C87 1099 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 CLCA4Q14CN2 919 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 KYAT1Q16773 422 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 SMTNL2Q2TAL5 461 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 EOGTQ5NDL2 527 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ANKS6Q68DC2 871 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 NIPAL1Q6NVV3 410 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 USP43Q70EL4 1123 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 KCNK18Q7Z418 384 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 PRUNE1Q86TP1 453 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 KRT78Q8N1N4 520 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ARHGAP24Q8N264 748 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 DEFB119Q8N690 84 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 FSIP1Q8NA03 581 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 OR52N1Q8NH53 320 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 LRRC15Q8TF66 581 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 ZUFSPQ96AP4 578 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 OLFM1Q99784 485 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 KCNS3Q9BQ31 491 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-212ENST00000535535 SYT15Q9BQS2 421 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.7 ms