RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFA2O43678 99 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ACADMP11310 421 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 RCAN2Q14206 197 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF79Q15937 498 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CYP27C1Q4G0S4 372 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SCIMPQ6UWF3 145 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PARM1Q6UWI2 310 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF852Q6ZMS4 543 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 TPRG1Q6ZUI0 275 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CREB3L2Q70SY1 520 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 OR8H3Q8N146 312 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 MARVELD3Q96A59 401 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 TESCQ96BS2 214 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 NPY6RQ99463 290 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PKMYT1Q99640 499 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 B3GNT2Q9NY97 397 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF224Q9NZL3 707 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 MPP6Q9NZW5 540 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 TNFRSF21O75509 655 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ANXA6P08133 673 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 TRAPPC2P0DI81 140 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 TYRP14679 529 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SLC1A2P43004 574 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGDIAP52565 204 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 KCNK10P57789 538 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 GALEQ14376 348 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC32Q14392 662 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 TIGD6Q17RP2 521 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ADHFE1Q8IWW8 467 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00518Q8N0U6 118 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PGBD5Q8N414 524 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CEP19Q96LK0 163 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 NELL2Q99435 816 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PIGVQ9NUD9 493 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 GPR45Q9Y5Y3 372 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 KCNE2Q9Y6J6 123 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PI15O43692 258 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ATG13O75143 517 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 MATN4O95460 622 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 TNNI3P19429 210 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ETV6P41212 452 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PIK3CBP42338 1070 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 TGM4P49221 684 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CYP4F2P78329 520 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CYP4F3Q08477 520 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 DHCR24Q15392 516 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 MSANTD2Q6P1R3 559 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 DET1Q7L5Y6 550 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 GPR151Q8TDV0 419 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 RIT1Q92963 219 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PTERQ96BW5 349 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 RHBDF1Q96CC6 855 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 P2RY13Q9BPV8 354 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ALG9Q9H6U8 611 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 OBP2AQ9NY56 170 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 A3GALT2U3KPV4 340 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 E9PAM4 449 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 BET1O15155 118 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CDK14O94921 469 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 POU2F2P09086 479 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 RPS24P62847 133 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 EMX2Q04743 252 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 GRM7Q14831 915 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 POU4F3Q15319 338 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 UNC50Q53HI1 259 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 LIPIQ6XZB0 460 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CHST9Q7L1S5 443 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SYVN1Q86TM6 617 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SLC2A13Q96QE2 648 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SLC22A12Q96S37 553 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC32Q9BV29 185 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00597Q9H2U6 94 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ACTR8Q9H981 624 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 IL21Q9HBE4 155 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 MID1IP1Q9NPA3 183 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC182A6NF36 153 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 HHLA1C9JL84 531 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ECI2O75521 394 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PRAMEF12O95522 483 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00271P0C7V0 271 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 IGFBP5P24593 272 aa9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms