RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARMCX5Q6P1M9 558 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NCEH1Q6PIU2 408 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGFL1Q6UW32 110 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MCM10Q7L590 875 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CEND1Q8N111 149 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF491Q8N8L2 437 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR5M9Q8NGP3 310 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR1B1Q8NGR6 318 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ETNPPLQ8TBG4 499 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GANCQ8TET4 914 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 METTL21AQ8WXB1 218 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC39A13Q96H72 371 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF670Q9BS34 389 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NEDD4P46934 1319 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A087WZ39 114 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 INPP4BO15327 924 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 POLBP06746 335 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CD1DP15813 335 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACSL1P33121 698 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BRCC3P46736 316 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC25A1P53007 311 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TAF12Q16514 161 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TAZQ16635 292 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DUSP5Q16690 384 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCK2Q16822 640 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AGAP6Q5VW22 663 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR4A47Q6IF82 309 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SARM1Q6SZW1 724 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMCO3Q6UWJ1 677 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TFAP2EQ6VUC0 442 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LINC01555Q8NAE3 123 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EXOC4Q96A65 974 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SERINC2Q96SA4 455 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCSER1Q9C0I3 900 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WDR41Q9HAD4 459 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 THYN1Q9P016 225 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HACL1Q9UJ83 578 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 B4DXG7 233 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 VPREB1P12018 145 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRAPPC10P48553 1259 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FNTAP49354 379 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EFNA3P52797 238 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CXCL6P80162 114 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RFWD3Q6PCD5 774 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IL17RELQ6ZVW7 336 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR4K1Q8NGD4 311 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DEDD2Q8WXF8 326 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TBC1D17Q9HA65 648 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 INPP5EQ9NRR6 644 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TBC1D13Q9NVG8 400 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GGA3Q9NZ52 723 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RNF123Q5XPI4 1314 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LNP1A1A4G5 178 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NKX6-3A6NJ46 265 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCT8L1PA6NM43 557 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRSS46E5RG02 174 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SAP30O75446 220 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGKV1D-16P01601 117 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGHV2-70P01814 119 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RIPPLY3P57055 190 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CXCL9Q07325 125 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TEX35Q5T0J7 233 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RCOR2Q8IZ40 523 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM61Q8N0U2 210 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPR137CQ8N3F9 429 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NME8Q8N427 588 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BANPQ8N9N5 519 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CASP10Q92851 521 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MPP4Q96JB8 637 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCT8L2Q96SF2 557 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AGXT2Q9BYV1 514 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPATC1LQ9H0A9 340 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 Q9H8V8 135 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CPQQ9Y646 472 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SESN1Q9Y6P5 492 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NPHP3Q7Z494 1330 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A0G2JLM5 398 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LIPT2A6NK58 231 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF487B1APH4 448 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EMC8O43402 210 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IRF2P14316 349 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MMP9P14780 707 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CD27P26842 260 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GCKRQ14397 625 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OPCMLQ14982 345 aa0.68□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms