RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516724.1

RNU6-572P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 572, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-572P, Length 80 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-572P-201ENST00000516724 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 KCTD11Q693B1 232 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 PM20D1Q6GTS8 502 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 TMEM207Q6UWW9 146 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 SLC24A5Q71RS6 500 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 FCRLAQ7L513 359 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 LSMEM2Q8N112 164 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 GPC2Q8N158 579 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZNF843Q8N446 348 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 TMEM99Q8N816 258 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 ARL10Q8N8L6 244 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 OR2T11Q8NH01 316 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 OR1L3Q8NH93 324 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZNRF4Q8WWF5 429 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZNF524Q96C55 264 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 CFAP36Q96G28 342 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 GAL3ST4Q96RP7 486 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 OSBPL8Q9BZF1 889 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 THAP2Q9H0W7 228 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 RAB9BQ9NP90 201 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 TBC1D13Q9NVG8 400 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 MIS18AQ9NYP9 233 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 MOSPD1Q9UJG1 213 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 FBXL4Q9UKA2 621 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 ICAM5Q9UMF0 924 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 NSG2Q9Y328 171 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-572P-201ENST00000516724 NPHP3Q7Z494 1330 aa2.59□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 STK36Q9NRP7 1315 aa2.59□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 ABCC9O60706 1549 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 A0A087X0K7 114 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 BICDL2A1A5D9 508 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 MAGEB16A2A368 324 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 ANTXRLA6NF34 631 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 ANKDD1BA6NHY2 528 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 SNURFLB1AK76 121 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 I3L1I5 382 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZBTB14O43829 449 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 CLN5O75503 358 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 TRMUO75648 421 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 SEC24AO95486 1093 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 HMOX1P09601 288 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 SBK2P0C263 348 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 PRSS56P0CW18 603 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 DUTP33316 252 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 CDKN1AP38936 164 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 ADARP55265 1226 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 ABRQ12979 859 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 PTPN14Q15678 1187 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 MAPK11Q15759 364 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 EXT1Q16394 746 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZNF74Q16587 644 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZNF542PQ5EBM4 170 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 ETFRF1Q6IPR1 90 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 LEKR1Q6ZMV7 388 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 MACC1Q6ZN28 852 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 COX8CQ7Z4L0 72 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 PRSS42Q7Z5A4 293 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 CNTN4Q8IWV2 1026 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 PEX5LQ8IYB4 626 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 TRIM58Q8NG06 486 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 OR5AP2Q8NGF4 316 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 OR8H1Q8NGG4 311 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 OR10G8Q8NGN5 311 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 ST7LQ8TDW4 575 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 SNX21Q969T3 373 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 LGALS12Q96DT0 336 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 C10orf90Q96M02 699 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 NODALQ96S42 347 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZNF559Q9BR84 538 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 NYXQ9GZU5 481 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 TSPYL1Q9H0U9 437 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 THAP9Q9H5L6 903 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 C5orf66Q9H5L9 145 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 MAGEF1Q9HAY2 307 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 SLC52A3Q9NQ40 469 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-572P-201ENST00000516724 PANK4Q9NVE7 773 aa2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms