RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516637.1

RNU6-405P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 405, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-405P, Length 110 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-405P-201ENST00000516637 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 SLC22A15Q8IZD6 547 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 CD177Q8N6Q3 437 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 C4orf32Q8N8J7 132 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 OR4C15Q8NGM1 316 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 CYYR1Q96J86 154 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 NDNQ99608 321 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 APOL6Q9BWW8 343 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 SDCBP2Q9H190 292 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 ACTL8Q9H568 366 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 TBC1D7Q9P0N9 293 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 PRO0461Q9UI25 63 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 NPHP3Q7Z494 1330 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 ATRXP46100 2492 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 PDHXO00330 501 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 SERPING1P05155 500 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 F3P13726 295 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 GPR183P32249 361 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 SFTPDP35247 375 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 FHL5Q5TD97 284 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 AVL9Q8NBF6 648 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZNF581Q9P0T4 197 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 CLIP2Q9UDT6 1046 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 IL36AQ9UHA7 158 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 RPS6KA6Q9UK32 745 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 PILRBQ9UKJ0 227 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 TRPV2Q9Y5S1 764 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 NEDD4P46934 1319 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 MAGEB2O15479 319 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 SH3BGRLO75368 114 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 CELF2O95319 508 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 LMO2P25791 158 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 NNMTP40261 264 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 EIF5P55010 431 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 UBASH3AP57075 661 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 DLK1P80370 383 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 NDPQ00604 133 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 RALGDSQ12967 914 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 C9orf66Q5T8R8 295 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 FAM166AQ6J272 317 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 IQCHQ86VS3 1027 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 OR9Q2Q8NGE9 314 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 OR4Q3Q8NH05 313 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 CCDC68Q9H2F9 335 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 RNF121Q9H920 327 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 IL1RAPQ9NPH3 570 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 FBXL4Q9UKA2 621 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 PILRAQ9UKJ1 303 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 POMT2Q9UKY4 750 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 PLCL2Q9UPR0 1127 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 IL16Q14005 1332 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 C17orf105B2RV13 164 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 F8VVB4 439 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 F8VWA3 439 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 RNF103O00237 685 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZNF749O43361 778 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 AHCYL1O43865 530 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 TADA2AO75478 443 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 PSMD10O75832 226 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 GFPT2O94808 682 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 RENP00797 406 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 THY1P04216 161 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 OR52Z1P0C646 297 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 ADORA3P0DMS8 318 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 CD59P13987 128 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 C4BPBP20851 252 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 MC5RP33032 325 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 LIMK1P53667 647 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 SRPXP78539 464 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 ACSM1Q08AH1 577 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 ALCAMQ13740 583 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 PTGISQ16647 500 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 LEMD1Q68G75 181 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 KRT39Q6A163 491 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 TLK2Q86UE8 772 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 AGAP11Q8TF27 550 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 CASP10Q92851 521 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 C11orf52Q96A22 123 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-405P-201ENST00000516637 NXPE2Q96DL1 559 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms