RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 C22orf39Q6P5X5 142 aa26.1■■□□□ 1.77
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SH3BP2-221ENST00000511747 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
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SH3BP2-221ENST00000511747 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
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SH3BP2-221ENST00000511747 TCEAL8Q8IYN2 117 aa26.09■■□□□ 1.77
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SH3BP2-221ENST00000511747 PRM3Q9NNZ6 103 aa26.09■■□□□ 1.77
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SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM202A6NGA9 273 aa26.08■■□□□ 1.77
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SH3BP2-221ENST00000511747 CD40LGP29965 261 aa26.08■■□□□ 1.77
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SH3BP2-221ENST00000511747 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.771e-11■■■■■ 35.9
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SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC103Q8IW40 242 aa26.08■■□□□ 1.77
SH3BP2-221ENST00000511747 C11orf65Q8NCR3 313 aa26.08■■□□□ 1.77
SH3BP2-221ENST00000511747 SH3BP4Q9P0V3 963 aa26.08■■□□□ 1.77
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SH3BP2-221ENST00000511747 SLC5A8Q8N695 610 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2-221ENST00000511747 OR52J3Q8NH60 311 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2-221ENST00000511747 MYDGFQ969H8 173 aa26.07■■□□□ 1.76
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SH3BP2-221ENST00000511747 TEAD4Q15561 434 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2-221ENST00000511747 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2-221ENST00000511747 ANXA8L1Q5VT79 327 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2-221ENST00000511747 GRHL2Q6ISB3 625 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2-221ENST00000511747 DNAJC22Q8N4W6 341 aa26.07■■□□□ 1.76
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