RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 CENPKQ9BS16 269 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 APOOQ9BUR5 198 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 C9orf16Q9BUW7 83 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 OSBPL11Q9BXB4 747 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 NTN4Q9HB63 628 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 OLAHQ9NV23 265 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PDP2Q9P2J9 529 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 FZD4Q9ULV1 537 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PLAGL1Q9UM63 463 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 INVSQ9Y283 1065 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 WDR37Q9Y2I8 494 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 AK5Q9Y6K8 562 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 WDFY4Q6ZS81 3184 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM149AA5PLN7 773 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 SAC3D1A6NKF1 404 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 SHISA7A6NL88 538 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TXNDC9O14530 226 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 FPGTO14772 594 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PCDH7O60245 1069 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 CREG1O75629 220 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 RASAL1O95294 804 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 LDLRP01130 860 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 C1QCP02747 245 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 RETP07949 1114 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 LINGO3P0C6S8 592 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 COX7A2P14406 83 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 DRD1P21728 446 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 SOX11P35716 441 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 CLCNKAP51800 687 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PDE7AQ13946 482 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 MAP7Q14244 749 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PON2Q15165 354 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 NKG7Q16617 165 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 CPTPQ5TA50 214 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM71E1Q6IPT2 247 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 COMMD6Q7Z4G1 85 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 SERPINA11Q86U17 422 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 CARM1Q86X55 608 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PGBD3Q8N328 593 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF740Q8NDX6 193 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 WDR48Q8TAF3 677 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 GANCQ8TET4 914 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 CAMK1GQ96NX5 476 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 CIB1Q99828 191 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 DUSP26Q9BV47 211 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 UGT2B28Q9BY64 529 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PCBD2Q9H0N5 130 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 REEP4Q9H6H4 257 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 ADGRE2Q9UHX3 823 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PCDHGB4Q9UN71 923 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 C1orf226A1L170 272 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PRR23AA6NEV1 266 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 CLIC1O00299 241 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 GSTA4O15217 222 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 CLOCKO15516 846 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 NARSO43776 548 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TPST1O60507 370 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 SH3BGRLO75368 114 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 GMNNO75496 209 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 SEMA3DO95025 777 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TGFB1P01137 390 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC35G4P0C7Q5 338 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 RAP2AP10114 183 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 ACP5P13686 325 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 ENGP17813 658 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 KIAA1024LP59773 190 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP2CBP62714 309 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP2CAP67775 309 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 REEP5Q00765 189 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 MYBPC1Q00872 1141 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 CHRNB3Q05901 458 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC74AQ0VAA2 488 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC14A1Q13336 389 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 NRF1Q16656 503 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 HKDC1Q2TB90 917 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF385BQ569K4 471 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 TMTC4Q5T4D3 741 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 DEPDC1Q5TB30 811 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP2-209ENST00000504450 ANXA8L1Q5VT79 327 aa10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms