RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 VMP1Q96GC9 406 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC138Q96M89 665 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 BIRC8Q96P09 236 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF358Q9NW07 568 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM160Q9NX00 188 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC88CQ9P219 2028 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa7.22□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa7.22□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 SLC22A16Q86VW1 577 aa7.22□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 OR4N4Q8N0Y3 316 aa7.22□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 FAM173AQ9BQD7 235 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 PACSIN1Q9BY11 444 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 PIGMQ9H3S5 423 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 PSD3Q9NYI0 1048 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 PAK5Q9P286 719 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 TRPC4Q9UBN4 977 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 H7C0C1 242 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 HSD17B7P56937 341 aa7.22□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 SLC25A12O75746 678 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 FHP07954 510 aa7.22□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 VRK3Q8IV63 474 aa7.22□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 UBP1Q9NZI7 540 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 LRFN1Q9P244 771 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 SOX13Q9UN79 622 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 ARHGEF33A8MVX0 844 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 E7ENX8 843 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 PEX1O43933 1283 aa7.21□□□□□ -1.26
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