RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RUNDC3AQ59EK9 446 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF773Q6PK81 442 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYTL1Q8IYJ3 562 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EID3Q8N140 333 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF740Q8NDX6 193 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC12A9Q9BXP2 914 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLMPQ9H6B4 373 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VNN3Q9NY84 501 aa14.97□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCN2AQ99250 2005 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRSS23O95084 383 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FKBP9O95302 570 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NTRK1P04629 796 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCNA2P20248 432 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNTN1Q12860 1018 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DGCR6Q14129 220 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERAP2Q6P179 960 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FKBP9P1Q75LS8 142 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VTCN1Q7Z7D3 282 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM20CQ8IXL6 584 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FGF14Q92915 247 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM129BQ96TA1 746 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF639Q9UID6 485 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR1A2Q9Y585 309 aa14.96□□□□□ -0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF197O14709 1029 aa14.96□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDH8O95206 1070 aa14.96□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAT2P11245 290 aa14.96□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CRHBPP24387 322 aa14.96□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCTP40126 519 aa14.96□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPATS1Q496A3 300 aa14.96□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GALNT18Q6P9A2 607 aa14.96□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VITQ6UXI7 678 aa14.96□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRR23BQ6ZRT6 265 aa14.96□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.96□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.96□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PKP4Q99569 1192 aa14.96□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.96□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYO1DO94832 1006 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SDC1P18827 310 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NR4A2P43354 598 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DOC2AQ14183 400 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGTRAPQ6RW13 159 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMPRSS11BQ86T26 416 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHPFQ8IZ52 775 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLECL1Q8IZS7 167 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMARCD2Q92925 531 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TPD52L3Q96J77 140 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PANX1Q96RD7 426 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FZD3Q9NPG1 666 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H0YAE9 185 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TNFRSF10AO00220 468 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SULT1C4O75897 302 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INMTO95050 263 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADRB3P13945 408 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCKP27707 260 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLA2G16P53816 162 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NFATC3Q12968 1075 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNASE1L3Q13609 305 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C6orf141Q5SZD1 244 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PARM1Q6UWI2 310 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPARTQ8N0X7 666 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TANKQ92844 425 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RASSF1Q9NS23 344 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXO10Q9UK96 956 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGLON5A6NGN9 336 aa14.94□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BCL10O95999 233 aa14.94□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C7P10643 843 aa14.94□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP2A7P20853 494 aa14.94□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TIE1P35590 1138 aa14.94□□□□□ -0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRPC1P48995 793 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.5 ms