RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 TUBB8Q3ZCM7 444 aa22.74■■□□□ 1.23
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SMKR1-201ENST00000462322 TMPRSS11BQ86T26 416 aa22.74■■□□□ 1.23
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SMKR1-201ENST00000462322 STAG3L4Q8TBR4 150 aa22.7■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 NT5CQ8TCD5 201 aa22.7■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM79Q9BSE2 394 aa22.7■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SMKR1-201ENST00000462322 DNAJC11Q9NVH1 559 aa22.7■■□□□ 1.22
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