RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MUM1Q2TAK8 710 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 KIRREL2Q6UWL6 708 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MRGPREQ86SM8 312 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 TMPRSS11BQ86T26 416 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 GPSM1Q86YR5 675 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF175Q8N4F7 328 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CEP112Q8N8E3 955 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 PDPRQ8NCN5 879 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MNS1Q8NEH6 495 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5T3Q8NGG3 340 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 OR9A4Q8NGU2 314 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 STT3BQ8TCJ2 826 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CREB3L4Q8TEY5 395 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 DCAKDQ8WVC6 231 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 THAP4Q8WY91 577 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 EXT2Q93063 718 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 C8orf44Q96CB5 159 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 CABS1Q96KC9 395 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 EGFL8Q99944 293 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 NUDT9Q9BW91 350 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC26A1Q9H2B4 701 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ADNPQ9H2P0 1102 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ALG9Q9H6U8 611 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 SNX15Q9NRS6 342 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGEF1-206ENST00000461017 NBASA2RRP1 2371 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBC2A0A5B9 178 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF860A6NHJ4 632 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 MAP2K7O14733 419 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 RIPK2O43353 540 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SUV39H1O43463 412 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 OR1F1O43749 312 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 RFPL1O75677 317 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SBK3P0C264 359 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 FOLR3P41439 243 aa6.64□□□□□ -1.35
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RABGEF1-206ENST00000461017 CD97P48960 835 aa6.64□□□□□ -1.35
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLC12A2P55011 1212 aa6.64□□□□□ -1.35
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RABGEF1-206ENST00000461017 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 GARNL3Q5VVW2 1013 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ATG9BQ674R7 924 aa6.64□□□□□ -1.35
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RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLC13A3Q8WWT9 602 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC5A11Q8WWX8 675 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ISL2Q96A47 359 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 COL26A1Q96A83 441 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 FKBP10Q96AY3 582 aa6.64□□□□□ -1.35
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RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.64□□□□□ -1.35
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RABGEF1-206ENST00000461017 PCBD2Q9H0N5 130 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TXNDC16Q9P2K2 825 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CSAG2Q9Y5P2 127 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SVILO95425 2214 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A096LPK6 155 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0G2JN53 185 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM227AF5H4B4 570 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 AGPSO00116 658 aa6.63□□□□□ -1.35
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