RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC63Q8NA47 563 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 PMEPA1Q969W9 287 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 OR2A5Q96R48 311 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SARGQ9BW04 601 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 H0YGG7 62 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 TXNDC9O14530 226 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 HCRTR1O43613 425 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 NRP2O60462 931 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SPAG7O75391 227 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 HBQ1P09105 142 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 PLA2G2AP14555 144 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CPA3P15088 417 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CASP2P42575 452 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 PRKAA2P54646 552 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 HERVK_113P63132 956 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 REEP5Q00765 189 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 IRF8Q02556 426 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 LAPTM5Q13571 262 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 GTF2H2Q13888 395 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 TBCCQ15814 346 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 AGBL2Q5U5Z8 902 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF605Q86T29 641 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 KRT78Q8N1N4 520 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 MFSD9Q8NBP5 474 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 TTC9Q92623 222 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 WDR34Q96EX3 536 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ERVK-6Q9BXR3 956 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 FOXJ2Q9P0K8 574 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC14BA6NHZ5 514 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 G3V2L1 256 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 H3BMH7 237 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 K7ENP7 123 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 E2F3O00716 465 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 TYROBPO43914 113 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SCRG1O75711 98 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CREB1P16220 341 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 EPORP19235 508 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 IMPDH1P20839 514 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 MAGEA8P43361 318 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SCTRP47872 440 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 NAA20P61599 178 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CHIT1Q13231 466 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CLN3Q13286 438 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 GRM7Q14831 915 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 XKR6Q5GH73 641 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 PAGE2BQ5JRK9 111 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 WASHC2DQ5SRD0 308 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 FRMPD2BQ6IN97 320 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 OR4N4Q8N0Y3 316 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 TCP10LQ8TDR4 215 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 EFCAB11Q9BUY7 163 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 NLNQ9BYT8 704 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ULBP3Q9BZM4 244 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SPRY4Q9C004 299 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 NT5DC2Q9H857 520 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 PCTPQ9UKL6 214 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 FEZF1A0PJY2 475 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 FITM1A5D6W6 292 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 STMND1H3BQB6 276 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF749O43361 778 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 OR1F1O43749 312 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 STK17BO94768 372 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 RPS17P08708 135 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 VARSP26640 1264 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 AHRP35869 848 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 BCL6P41182 706 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ARSFP54793 590 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 EMP3P54852 163 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 DNAJB13P59910 316 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 RIPK1Q13546 671 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 DOC2AQ14183 400 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms