RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 LYSMD4Q5XG99 296 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF529Q6P280 563 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PAQR7Q86WK9 346 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SYT12Q8IV01 421 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZBTB2Q8N680 514 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TTC9BQ8N6N2 239 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF148Q8N7C7 305 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NIPA2Q8N8Q9 360 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ACBD4Q8NC06 268 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM13CQ8NE31 585 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MFSD8Q8NHS3 518 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ALG3Q92685 438 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RFKQ969G6 155 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DPYSL5Q9BPU6 564 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FEM1AQ9BSK4 669 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PBDC1Q9BVG4 233 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC106Q9BWC9 280 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PCBD2Q9H0N5 130 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LINC00597Q9H2U6 94 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SEMA4AQ9H3S1 761 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 S100A14Q9HCY8 104 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GNG13Q9P2W3 67 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CKLFQ9UBR5 152 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PCYOX1Q9UHG3 505 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DGKBQ9Y6T7 804 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FADS2P1A8MWK0 482 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TTC34A8MYJ7 566 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZBTB42B2RXF5 422 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PEX12O00623 359 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GABRDO14764 452 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RIPK2O43353 540 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 OR1I1O60431 355 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ERN1O75460 977 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 BEST1O76090 585 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 KCNH1O95259 989 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MLYCDO95822 493 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PLATP00750 562 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ESR1P03372 595 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NUDT17P0C025 328 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 JUPP14923 745 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 IRS1P35568 1242 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RPL3P39023 403 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 UGT2B15P54855 530 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RAB10P61026 200 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM44Q2T9K0 475 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 COL28A1Q2UY09 1125 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TSTD2Q5T7W7 516 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM171BQ6P995 826 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PAOXQ6QHF9 649 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 IL27RAQ6UWB1 636 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ASRGL1Q7L266 308 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZBTB46Q86UZ6 589 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC34A3Q8N130 599 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FNDC5Q8NAU1 212 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SHKBP1Q8TBC3 707 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CD300LFQ8TDQ1 290 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 WDR92Q96MX6 357 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 OR2M4Q96R27 311 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MGME1Q9BQP7 344 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TBCDQ9BTW9 1192 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TMED9Q9BVK6 235 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FUNDC2Q9BWH2 189 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC46A2Q9BY10 475 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ABCB9Q9NP78 766 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TMLHEQ9NVH6 421 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 C1orf109Q9NX04 203 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC167Q9P0B6 97 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ARMCX1Q9P291 453 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM59LQ9UK28 342 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TCAF1Q9Y4C2 921 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa4.28□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 J3KR12 359 aa4.28□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PI15O43692 258 aa4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms