RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 FOXL2P58012 376 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 CHIT1Q13231 466 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 DOC2AQ14183 400 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 ERV3-1Q14264 604 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.226e-7■■■■■ 37.3
UBE2E3-202ENST00000410062 GARNL3Q5VVW2 1013 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 COX15Q7KZN9 410 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 EHD1Q9H4M9 534 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 CCDC88CQ9P219 2028 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 GSTA1P08263 222 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 EPB42P16452 691 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 CD22P20273 847 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 CXCR2P25025 360 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 AHRP35869 848 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 IRF8Q02556 426 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 PRMT9Q6P2P2 845 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 COL26A1Q96A83 441 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 C17orf62Q9BQA9 187 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 DRC3Q9H069 523 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF304Q9HCX3 659 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 DCDC2Q9UHG0 476 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 TCFL5Q9UL49 500 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 TMCO1Q9UM00 188 aa22.68■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 I3L1I5 382 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 E2F3O00716 465 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 FOXS1O43638 330 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 KRT4P19013 534 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 NDUFA9Q16795 377 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 C4orf33Q8N1A6 199 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 KRT78Q8N1N4 520 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 WDR34Q96EX3 536 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 A8MT66 165 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 STX16O14662 325 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 ONECUT2O95948 504 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 FURINP09958 794 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 CDC20Q12834 499 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 PWP1Q13610 501 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 IL10RAQ13651 578 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 GTF2H2Q13888 395 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 OVCH1Q7RTY7 1134 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 PRSS41Q7RTY9 318 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM151BQ8IW70 566 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 CTSFQ9UBX1 484 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 LGALS13Q9UHV8 139 aa22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 ATMQ13315 3056 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 GLRA3O75311 464 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 WFS1O76024 890 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 MC1RQ01726 317 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM53BQ14153 422 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 TBCCQ15814 346 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 SYVN1Q86TM6 617 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 TRPV3Q8NET8 790 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 OR9A4Q8NGU2 314 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 NT5CQ8TCD5 201 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 MVB12AQ96EY5 273 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 EFCAB11Q9BUY7 163 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 COPG2Q9UBF2 871 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 EMCNQ9ULC0 261 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 CDC14AQ9UNH5 594 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 PADI2Q9Y2J8 665 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 SCN3AQ9NY46 2000 aa22.66■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 FFAR3O14843 346 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 GPR42O15529 346 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 IL1RNP18510 177 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 TAC1P20366 129 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 FBLP22087 321 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 CASP2P42575 452 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 RGS1Q08116 209 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 ADNP2Q6IQ32 1131 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 CREB3L4Q8TEY5 395 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 FKBP10Q96AY3 582 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM117AQ9C073 453 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 NT5DC2Q9H857 520 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 IPPKQ9H8X2 491 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 PCTPQ9UKL6 214 aa22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 CDC14CA4D256 554 aa22.64■■□□□ 1.22
UBE2E3-202ENST00000410062 COPEO14579 308 aa22.64■■□□□ 1.22
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