RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
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PRAME-204ENST00000403441 ICE2Q659A1 982 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 SUSD1Q6UWL2 747 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 ADCK2Q7Z695 626 aa11.69□□□□□ -0.54
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PRAME-204ENST00000403441 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
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PRAME-204ENST00000403441 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
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PRAME-204ENST00000403441 STMN3Q9NZ72 180 aa11.69□□□□□ -0.54
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PRAME-204ENST00000403441 TAC3Q9UHF0 121 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 SNX24Q9Y343 169 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 DHRS7Q9Y394 339 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 F8P00451 2351 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 E5RI56 91 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 SLC19A2O60779 497 aa11.68□□□□□ -0.54
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PRAME-204ENST00000403441 C1QAP02745 245 aa11.68□□□□□ -0.54
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PRAME-204ENST00000403441 CYC1P08574 325 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 F7P08709 466 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 CHRM3P20309 590 aa11.68□□□□□ -0.54
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PRAME-204ENST00000403441 PNLIPRP1P54315 467 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 ABATP80404 500 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 MPP1Q00013 466 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 RELAQ04206 551 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 FAM53BQ14153 422 aa11.68□□□□□ -0.54
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PRAME-204ENST00000403441 MFSD4BQ5TF39 518 aa11.68□□□□□ -0.54
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PRAME-204ENST00000403441 XKRXQ6PP77 449 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 TMEM205Q6UW68 189 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 CD200R1Q8TD46 325 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 LURAP1Q96LR2 239 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 OR2A5Q96R48 311 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 TRIM31Q9BZY9 425 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 CHMP2BQ9UQN3 213 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 PKDREJQ9NTG1 2253 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 CSMD2Q7Z408 3487 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 CCDC168Q8NDH2 2452 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 A8MUI8 341 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 GFYI3L273 518 aa11.67□□□□□ -0.54
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PRAME-204ENST00000403441 SLC16A8O95907 504 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 AHSGP02765 367 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 SMSP52788 366 aa11.67□□□□□ -0.54
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PRAME-204ENST00000403441 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
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PRAME-204ENST00000403441 SYT16Q17RD7 645 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 KLHL38Q2WGJ6 581 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 BTBD16Q32M84 506 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 TTLL9Q3SXZ7 439 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 MINDY4Q4G0A6 757 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 ACSBG2Q5FVE4 666 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 ZNF766Q5HY98 468 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 PLAG1Q6DJT9 500 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 ZNF425Q6IV72 752 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 ZDHHC24Q6UX98 284 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 CYHR1Q6ZMK1 362 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 CYS1Q717R9 158 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 FBXO36Q8NEA4 188 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 MCOLN3Q8TDD5 553 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 IMMP1LQ96LU5 166 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 PKP4Q99569 1192 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 VN1R1Q9GZP7 353 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 ABCF3Q9NUQ8 709 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 PDZD2O15018 2839 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 FAM227AF5H4B4 570 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 H0YIG0 161 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 HAT1O14929 419 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 P2RX6O15547 441 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 SYF2O95926 243 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 MPC1LP0DKB6 136 aa11.66□□□□□ -0.54
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