RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 LRP8Q14114 963 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 CRY2Q49AN0 593 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 OR8J3Q8NGG0 315 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 CYP2S1Q96SQ9 504 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 AIF1LQ9BQI0 150 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 NDC1Q9BTX1 674 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 CACNG6Q9BXT2 260 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 GON7Q9BXV9 100 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 DAOAP59103 153 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 BCL7AQ4VC05 210 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 KANK2Q63ZY3 851 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 WASH2PQ6VEQ5 465 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 SPATC1Q76KD6 591 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 C14orf80Q86SX3 495 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 ITIH5Q86UX2 942 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 TMEM192Q8IY95 271 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 GPR151Q8TDV0 419 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 CASTOR1Q8WTX7 329 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 RBCK1Q9BYM8 510 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 PDZD7Q9H5P4 517 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 MOCS1Q9NZB8 636 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 RNF181Q9P0P0 153 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 FZD1Q9UP38 647 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 DERAQ9Y315 318 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 MROH2AA6NES4 1674 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 C7orf72A4D263 438 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 ZBTB7AO95365 584 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 PAHP00439 452 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 BCHEP06276 602 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 ALAS2P22557 587 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 OXTRP30559 389 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 AGTR2P50052 363 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 PRKCDQ05655 676 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 CDK5R2Q13319 367 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 SGCGQ13326 291 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 USP41Q3LFD5 358 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 KLHL26Q53HC5 615 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 POMZP3Q6PJE2 187 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 PLEKHH3Q7Z736 793 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 TSPAN33Q86UF1 283 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 CEP97Q8IW35 865 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 ADAM2Q99965 735 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 CDADC1Q9BWV3 514 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 OSER1Q9NX31 292 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 NDOR1Q9UHB4 597 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 STUB1Q9UNE7 303 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 ERVK-19Q9WJR5 959 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 ZNF541Q9H0D2 1346 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 MANBAO00462 879 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 INSIG1O15503 277 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 PRKCGP05129 697 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 PGAM2P15259 253 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 GSTM3P21266 225 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 SSTR4P31391 388 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 CDKN2CP42773 168 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 RGS19P49795 217 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 MLLT10P55197 1068 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 CREB5Q02930 508 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 SLC35G1Q2M3R5 365 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 KRBOX4Q5JUW0 171 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 ZNF676Q8N7Q3 588 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 OR8K3Q8NH51 312 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 ACDQ96AP0 544 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 MED30Q96HR3 178 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 PIGVQ9NUD9 493 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 VPS29Q9UBQ0 182 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 CYTH4Q9UIA0 394 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 KCTD3Q9Y597 815 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 ATRNL1Q5VV63 1379 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 OR6C74A6NCV1 312 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 SLC35E2BP0CK96 405 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 PSEN2P49810 448 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 FGL2Q14314 439 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 ELOA3BQ3SY89 546 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 TCEAL5Q5H9L2 206 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 ZNF248Q8NDW4 579 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 ELOA3Q8NG57 546 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 OR8S1Q8NH09 359 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 PTPN18Q99952 460 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-202ENST00000402738 BRINP2Q9C0B6 783 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms