RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395965.7

FAM172A-201, Transcript of family with sequence similarity 172 member A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM172A, Length 4,312 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM172A-201ENST00000395965 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 PRAF2O60831 178 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 HIST1H2ABP04908 130 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 UGT2B10P36537 528 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 ZNF132P52740 706 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 CDH8P55286 799 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 CTBSQ01459 385 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 GBE1Q04446 702 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 SEC23BQ15437 767 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 METTL11BQ5VVY1 283 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 PRSS48Q7RTY5 328 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 DENND1CQ8IV53 801 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 ZNF565Q8N9K5 539 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 OR1J4Q8NGS1 313 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 SPATA22Q8NHS9 363 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 ST7LQ8TDW4 575 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 HIST1H2ACQ93077 130 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 TMEM39BQ9GZU3 492 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 FBXL3Q9UKT7 428 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 ASB4Q9Y574 426 aa10□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 SOCS2O14508 198 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 CNTN5O94779 1100 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 MICAL2O94851 1124 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 TRBC1P01850 177 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 XKP51811 444 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 MBTD1Q05BQ5 628 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 ATG9BQ674R7 924 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 KCTD9Q7L273 389 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 NRARPQ7Z6K4 114 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 NEIL3Q8TAT5 605 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 UBE2E3Q969T4 207 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 E5RJQ4 531 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 PPP1R2P9O14990 202 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 SC5DO75845 299 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 UBBP0CG47 229 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 PRPS2P11908 318 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 SSTR2P30874 369 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 NOS2P35228 1153 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 DDOSTP39656 456 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 CDKN2BP42772 138 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 OR1G1P47890 313 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 LHX1P48742 406 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 SOX10P56693 466 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 RAB8AP61006 207 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 ERVK-21P61565 698 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 ETFRF1Q6IPR1 90 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 FAM171BQ6P995 826 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 NIPA1Q7RTP0 329 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 FAM35AQ86V20 835 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 DEFB106AQ8N104 65 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 C2orf69Q8N8R5 385 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 ZBTB44Q8NCP5 570 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 NDNFQ8TB73 568 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 RAD51AP1Q96B01 352 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 TMEM159Q96B96 161 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 SLC41A3Q96GZ6 507 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 FAM118AQ9NWS6 357 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 KLHL21Q9UJP4 597 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 CDH10Q9Y6N8 788 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 A0A1W2PP18 115 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 A0A1W2PQ09 198 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 CYTIPO60759 359 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 KERAO60938 352 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 ADAM23O75077 832 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 JRKO75564 520 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 CATP04040 527 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 ASMTP46597 345 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 TTPAP49638 278 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 BAK1Q16611 211 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 TMEM41BQ5BJD5 291 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 ZNF311Q5JNZ3 666 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 MFSD14CQ5VZR4 134 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 FCAMRQ8WWV6 532 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 MYLIPQ8WY64 445 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 KCNJ9Q92806 393 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 PPCDCQ96CD2 204 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 APOLD1Q96LR9 279 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 POTEKPQ9BYX7 375 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 TRIM36Q9NQ86 728 aa9.99□□□□□ -0.81
FAM172A-201ENST00000395965 NME7Q9Y5B8 376 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms