RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 C11orf74Q86VG3 221 aa12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 HORMAD1Q86X24 394 aa12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 FAM217AQ8IXS0 508 aa12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 HS6ST3Q8IZP7 471 aa12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 NLGN4XQ8N0W4 816 aa12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PXYLP1Q8TE99 480 aa12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 AGAP4Q96P64 663 aa12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PRDM8Q9NQV8 689 aa12.74□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SAGE2PA6NJ88 616 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 EFCAB9A8MZ26 197 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SH3BGRLO75368 114 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 EPN2O95208 641 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 MT-ND2P03891 347 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 C1SP09871 688 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC159P0C7I6 412 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ALOX12P18054 663 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PRPS1L1P21108 318 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SLC6A12P48065 614 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 DAPP51397 102 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 IRF8Q02556 426 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 HTR3DQ70Z44 454 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 VTCN1Q7Z7D3 282 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 TCEAL8Q8IYN2 117 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CHPFQ8IZ52 775 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SETD9Q8NE22 299 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 IL17RDQ8NFM7 739 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SUN5Q8TC36 379 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ELMO1Q92556 727 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF558Q96NG5 402 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 DCSTAMPQ9H295 470 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 BRD9Q9H8M2 597 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 B4GALT6Q9UBX8 382 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 GMPPBQ9Y5P6 360 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CRYZL1O95825 349 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 OLFM2O95897 454 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 FABP3P05413 133 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ITGAMP11215 1152 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SPINT3P49223 89 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ST13P50502 369 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SF1Q15637 639 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 VMACQ2NL98 169 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF404Q494X3 552 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 XKR6Q5GH73 641 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 C22orf39Q6P5X5 142 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 GAREM2Q75VX8 874 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SERPINA11Q86U17 422 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 HCAR2Q8TDS4 363 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CHAC2Q8WUX2 184 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 MED30Q96HR3 178 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 DMRTB1Q96MA1 342 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 MYOCQ99972 504 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 TM9SF3Q9HD45 589 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 IL1RAPQ9NPH3 570 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PLSCR3Q9NRY6 295 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 KIF17Q9P2E2 1029 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ICMTO60725 284 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 KCNK5O95279 499 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 MPC1LP0DKB6 136 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 JUPP14923 745 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PRPH2P23942 346 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 KDELR2P33947 212 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 MAGEA2P43356 314 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CDK10Q15131 360 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 WDR45BQ5MNZ6 344 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 SCN3BQ9NY72 215 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 RPS6KA6Q9UK32 745 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 TPRKBQ9Y3C4 175 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 MAGEB17A8MXT2 336 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CD36P16671 472 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 TGFBR2P37173 567 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 GNG2P59768 71 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 GALK2Q01415 458 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ABRQ12979 859 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 UGT8Q16880 541 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CEP78Q5JTW2 689 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 MPP7Q5T2T1 576 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 IQCF2Q8IXL9 164 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ZZZ3Q8IYH5 903 aa12.72□□□□□ -0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CLECL1Q8IZS7 167 aa12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms