RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369547.5

SYT6-201, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYT6, Length 4,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-201ENST00000369547 SOCS5O75159 536 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 INMTO95050 263 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 RB1P06400 928 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 ZNF30P17039 623 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 ATP4BP51164 291 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 RPL26P61254 145 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 SLC5A11Q8WWX8 675 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 GLYATL1Q969I3 302 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 SPHK2Q9NRA0 654 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 EBF1Q9UH73 591 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 CBSLP0DN79 551 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 CBSP35520 551 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 CCT3P49368 545 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 C6orf141Q5SZD1 244 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 NCEH1Q6PIU2 408 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 ALKAL1Q6UXT8 129 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 ALPK1Q96QP1 1244 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 ZIC5Q96T25 663 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 PRDM8Q9NQV8 689 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 ELOVL2Q9NXB9 296 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 SLC35F4A4IF30 521 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 TNFRSF10BO14763 440 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 MITFO75030 526 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 C8BP07358 591 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 SLC10A3P09131 477 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 FAM180AQ6UWF9 173 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 PEX5LQ8IYB4 626 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 OXR1Q8N573 874 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 ARRDC2Q8TBH0 407 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 HMGB4Q8WW32 186 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 ZFP3Q96NJ6 502 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 TREX1Q9NSU2 369 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa15.64■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 ZNF860A6NHJ4 632 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 H3BNH8 94 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 MUSKO15146 869 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 H1F0P07305 194 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 GNAO1P09471 354 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 MPIP34949 423 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 BTN3A2P78410 334 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 MYBPC1Q00872 1141 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 VMACQ2NL98 169 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 OR9A1PQ8NGU1 263 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 FRS2Q8WU20 508 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 SNX33Q8WV41 574 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 SMPDL3AQ92484 453 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 RGMAQ96B86 450 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 IFT27Q9BW83 186 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 TMED5Q9Y3A6 229 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 USP3Q9Y6I4 520 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 GABBR2O75899 941 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 NRIP1P48552 1158 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 PNLIPRP1P54315 467 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 ATP6AP1Q15904 470 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 ZNF773Q6PK81 442 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 FAM220AQ7Z4H9 259 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 MZB1Q8WU39 189 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 OARD1Q9Y530 152 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 ABCB7O75027 752 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 HTR1EP28566 365 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 TSTQ16762 297 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 CTC1Q2NKJ3 1217 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 RAB41Q5JT25 222 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 CRTC1Q6UUV9 634 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 ZFAND4Q86XD8 727 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 CCDC116Q8IYX3 515 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 GPR135Q8IZ08 494 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 DTWD1Q8N5C7 304 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 TCEANCQ8N8B7 351 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 RASSF5Q8WWW0 418 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 TMEM30AQ9NV96 361 aa15.63■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 SLC16A8O95907 504 aa15.62■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 APLP1P51693 650 aa15.62■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 ZNF763Q0D2J5 394 aa15.62■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 SIPA1Q96FS4 1042 aa15.62■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 APIPQ96GX9 242 aa15.62■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 EGLN2Q96KS0 407 aa15.62■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 MGME1Q9BQP7 344 aa15.62■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa15.62■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 VAPAQ9P0L0 249 aa15.62■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 C5AR2Q9P296 337 aa15.62■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 ERVK-18Q9QC07 812 aa15.62■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 AASSQ9UDR5 926 aa15.62■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 TAF13Q15543 124 aa15.62■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 TMEM236Q5W0B7 351 aa15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms