RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362378.1

RNU6-28P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 28, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-28P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-28P-201ENST00000362378 TIMP3P35625 211 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 MAGEA11P43364 429 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 DNA2P51530 1060 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 CDR2Q01850 454 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 ABRQ12979 859 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 TRIM29Q14134 588 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 PPA1Q15181 289 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 IFI44LQ53G44 452 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 PARP10Q53GL7 1025 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 ARMCX4Q5H9R4 360 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 CNSTQ6PJW8 725 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 TMEM207Q6UWW9 146 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 COX8CQ7Z4L0 72 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 ZNF410Q86VK4 478 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 LAX1Q8IWV1 398 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 GPC2Q8N158 579 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 ZNF619Q8N2I2 560 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 FAM89BQ8N5H3 189 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 TMEM99Q8N816 258 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 C9orf106Q8NAJ2 232 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 CLEC1AQ8NC01 280 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 KBTBD8Q8NFY9 601 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 TRIM58Q8NG06 486 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 OR4C3Q8NH37 302 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 OR1L3Q8NH93 324 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 DYRK2Q92630 601 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 WBP2Q969T9 261 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 ZNF524Q96C55 264 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 GIMAP5Q96F15 307 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 CFAP36Q96G28 342 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 C10orf90Q96M02 699 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 SLC39A8Q9C0K1 460 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 EGLN3Q9H6Z9 239 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 ANO10Q9NW15 660 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 OR6C2Q9NZP2 312 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 FBXL4Q9UKA2 621 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 PRDM4Q9UKN5 801 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 ZNF510Q9Y2H8 683 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-28P-201ENST00000362378 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 MSGN1A6NI15 193 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 E5RGE8 158 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 H3BMM5 538 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 SEC22BO75396 215 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 CLPTM1O96005 669 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 PRSS1P07477 247 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 FAM157CP0CG43 387 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 TYMPP19971 482 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 CLCN4P51793 760 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 SLC12A3P55017 1021 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 OR1D5P58170 312 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 FKBP1BP68106 108 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 PDE7AQ13946 482 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 MAPK11Q15759 364 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 ACKR1Q16570 336 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 ZNF542PQ5EBM4 170 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 ETFRF1Q6IPR1 90 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 ZNF790Q6PG37 636 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 LEKR1Q6ZMV7 388 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 TMEM126BQ8IUX1 230 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 SERPINA12Q8IW75 414 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 SLC37A3Q8NCC5 494 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 OR4C15Q8NGM1 316 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 OR2T11Q8NH01 316 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 TMEM237Q96Q45 408 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 PRAM1Q96QH2 718 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 LPAR4Q99677 370 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 PIGQQ9BRB3 760 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 SPXQ9BT56 116 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 TNMDQ9H2S6 317 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 EXOC1Q9NV70 894 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 PANK4Q9NVE7 773 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 TBC1D13Q9NVG8 400 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 PILRBQ9UKJ0 227 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 KCNJ14Q9UNX9 436 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 NSG2Q9Y328 171 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 A0A0G2JLW4 131 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 TMEM129A0AVI4 362 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 SNURFLB1AK76 121 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 M0R296 226 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 RTCAO00442 366 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 TEX28O15482 410 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 EXTL3O43909 919 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-28P-201ENST00000362378 KIF5CO60282 957 aa3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms