RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 YIPF2Q9BWQ6 316 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM54Q9BYV2 358 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 PPCSQ9HAB8 311 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 POPDC3Q9HBV1 291 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 C14orf105Q9NVL8 296 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 LUZP4Q9P127 313 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 C5AR2Q9P296 337 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 TRPC4Q9UBN4 977 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 C3orf18Q9UK00 162 aa7.28□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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SGMS1-201ENST00000361543 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa7.27□□□□□ -1.25
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SGMS1-201ENST00000361543 NFU1Q9UMS0 254 aa7.27□□□□□ -1.25
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SGMS1-201ENST00000361543 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 ATG9BQ674R7 924 aa7.26□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 FAAH2Q6GMR7 532 aa7.26□□□□□ -1.25
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