RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328020.10

CMTM1-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM1, Length 981 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-201ENST00000328020 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa13.46□□□□□ -0.25
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CMTM1-201ENST00000328020 WDR91A4D1P6 747 aa13.45□□□□□ -0.26
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CMTM1-201ENST00000328020 TMEM114B3SHH9 223 aa13.45□□□□□ -0.26
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CMTM1-201ENST00000328020 NDUFS4O43181 175 aa13.45□□□□□ -0.26
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CMTM1-201ENST00000328020 LAS2Q8IYD9 372 aa13.45□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 ZNF740Q8NDX6 193 aa13.45□□□□□ -0.26
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CMTM1-201ENST00000328020 OR52B6Q8NGF0 335 aa13.45□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa13.45□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 PROKR1Q8TCW9 393 aa13.45□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 CCT6BQ92526 530 aa13.45□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 CLIP3Q96DZ5 547 aa13.45□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 RHBGQ9H310 441 aa13.45□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 ZBTB26Q9HCK0 441 aa13.45□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 APMAPQ9HDC9 416 aa13.45□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 MID1IP1Q9NPA3 183 aa13.45□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 NMRK1Q9NWW6 199 aa13.45□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 CDC14AQ9UNH5 594 aa13.45□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 RNF11Q9Y3C5 154 aa13.45□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa13.45□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 ACACAQ13085 2346 aa13.45□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 A0A088AWK7 358 aa13.44□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa13.44□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa13.44□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 CDRT15L2A8MXV6 281 aa13.44□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 C9orf172C9J069 976 aa13.44□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 ZNF749O43361 778 aa13.44□□□□□ -0.26
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CMTM1-201ENST00000328020 NRP2O60462 931 aa13.44□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 CHEK2O96017 543 aa13.44□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 AGXTP21549 392 aa13.44□□□□□ -0.26
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CMTM1-201ENST00000328020 FOXK2Q01167 660 aa13.44□□□□□ -0.26
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CMTM1-201ENST00000328020 CHI3L2Q15782 390 aa13.44□□□□□ -0.26
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CMTM1-201ENST00000328020 FRG2Q64ET8 278 aa13.44□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 CHSY3Q70JA7 882 aa13.44□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 ABHD13Q7L211 337 aa13.44□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP13.44□□□□□ -0.26
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CMTM1-201ENST00000328020 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa13.44□□□□□ -0.26
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CMTM1-201ENST00000328020 METTL6Q8TCB7 284 aa13.44□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 NT5CQ8TCD5 201 aa13.44□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 TM4SF19Q96DZ7 209 aa13.44□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 MVB12AQ96EY5 273 aa13.44□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 CDK15Q96Q40 435 aa13.44□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 FRG2BQ96QU4 278 aa13.44□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 C17orf62Q9BQA9 187 aa13.44□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 MLXIPLQ9NP71 852 aa13.44□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 PFDN4Q9NQP4 134 aa13.44□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 CUTCQ9NTM9 273 aa13.44□□□□□ -0.26
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CMTM1-201ENST00000328020 ULK1O75385 1050 aa13.43□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 STK17BO94768 372 aa13.43□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 KIAA0754O94854 1291 aa13.43□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 HSPA4LO95757 839 aa13.43□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 TSPAN8P19075 237 aa13.43□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 CD22P20273 847 aa13.43□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 ALAS2P22557 587 aa13.43□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 AVPR1BP47901 424 aa13.43□□□□□ -0.26
CMTM1-201ENST00000328020 WDR4P57081 412 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
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