RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327443.8

SP1-201, Transcript of Sp1 transcription factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SP1, Length 2,846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP1-201ENST00000327443 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 EMCNQ9ULC0 261 aa9.5□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 MED16Q9Y2X0 877 aa9.5□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 CDY1Q9Y6F8 540 aa9.5□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 PLXNA3P51805 1871 aa9.5□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 CHD5Q8TDI0 1954 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 SLC1A7O00341 560 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 PER2O15055 1255 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 GSTA4O15217 222 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 ERN1O75460 977 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 PDE9AO76083 593 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 RASGRP1O95267 797 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 MPOP05164 745 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 FCGR1AP12314 374 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 LAP3P28838 519 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 SSTR2P30874 369 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 FGL1Q08830 312 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 HYAL2Q12891 473 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 KLHL17Q6TDP4 642 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 SCIMPQ6UWF3 145 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 RTL4Q6ZR62 310 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 SLC26A9Q7LBE3 791 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 SYVN1Q86TM6 617 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 RDH10Q8IZV5 341 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 RBFAQ8N0V3 343 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 PLD5Q8N7P1 536 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 DNAAF3Q8N9W5 541 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 ZNF248Q8NDW4 579 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 ASB15Q8WXK1 588 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 LINC01599Q8WXQ3 324 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 SLC45A3Q96JT2 553 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 DUSP16Q9BY84 665 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 PIGUQ9H490 435 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 SPAG4Q9NPE6 437 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 NDRG3Q9UGV2 375 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 TSPAN16Q9UKR8 245 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 HES2Q9Y543 173 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 EFCAB10A6NFE3 127 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 ZNF197O14709 1029 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 PPEF2O14830 753 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 LRIG2O94898 1065 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 TSPAN12O95859 305 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 FADS2O95864 444 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 GP1BAP07359 652 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 CTSHP09668 335 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 CD19P15391 556 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 CA5AP35218 305 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 OR1G1P47890 313 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 XKP51811 444 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 DYNLT1P63172 113 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 INPP5AQ14642 412 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 QPRTQ15274 297 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 GPR19Q15760 415 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 ZNF528Q3MIS6 628 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 NOMO2Q5JPE7 1267 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 FAXCQ5TGI0 409 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 LAIR2Q6ISS4 152 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 CD300LGQ6UXG3 332 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 IFNEQ86WN2 208 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 ZFP82Q8N141 532 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 CNTD1Q8N815 330 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 ZNF540Q8NDQ6 660 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 MOCOSQ96EN8 888 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 SENP8Q96LD8 212 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 QRFPRQ96P65 431 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 SORCS2Q96PQ0 1159 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 ALG2Q9H553 416 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 CDCP1Q9H5V8 836 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 CD300AQ9UGN4 299 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 TBX21Q9UL17 535 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 KCNK7Q9Y2U2 307 aa9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 ANKDD1BA6NHY2 528 aa9.48□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 E7ESA3 106 aa9.48□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 M0QYV0 167 aa9.48□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 DCLK1O15075 740 aa9.48□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 AIREO43918 545 aa9.48□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 WBP4O75554 376 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 MPC2O95563 127 aa9.48□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 EFEMP2O95967 443 aa9.48□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 MBP02144 154 aa9.48□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 HRGP04196 525 aa9.48□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 NRIP1P48552 1158 aa9.48□□□□□ -0.89
SP1-201ENST00000327443 PSMD8P48556 350 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms