RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRABP2P29373 138 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCTRP47872 440 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 AVPR1BP47901 424 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLRB1Q12918 225 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 COLEC12Q5KU26 742 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 NXPE4Q6UWF7 544 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIRREL2Q6UWL6 708 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 LAPTM4BQ86VI4 370 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCAIMQ8N3R3 496 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLEC1AQ8NC01 280 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDPRQ8NCN5 879 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 MOCOSQ96EN8 888 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM4Q9C037 500 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGSF5Q9NSI5 407 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR83Q9NYM4 423 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 WWOXQ9NZC7 414 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 C3orf18Q9UK00 162 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNE2Q9Y6J6 123 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 H0YIG0 161 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 J3QKU1 62 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFS4O43181 175 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 VARSP26640 1264 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 GGT5P36269 586 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAPSNQ13702 412 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXO48Q5FWF7 155 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDKL4Q5MAI5 379 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 MROH9Q5TGP6 573 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDSS2Q86YH6 399 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHISA5Q8N114 240 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 GALNT16Q8N428 558 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR11G2Q8NGC1 345 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 EXT2Q93063 718 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 YIPF2Q9BWQ6 316 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 TGIF2Q9GZN2 237 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPN3Q9H201 632 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALG9Q9H6U8 611 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX15Q9NRS6 342 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFP69BQ9UJL9 534 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 TFEBP19484 476 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 CASRP41180 1078 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNC1P48547 511 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 EFNA3P52797 238 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 IRF9Q00978 393 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDC16Q13042 620 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 PWP1Q13610 501 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUBB8Q3ZCM7 444 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 SULT1C3Q6IMI6 304 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 ISCA2Q86U28 154 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D19Q8N5T2 526 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD53Q8N9V6 530 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRN4CLQ8ND94 238 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 NT5CQ8TCD5 201 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCTD4Q8WVF5 259 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 AIF1LQ9BQI0 150 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 NMRAL1Q9HBL8 299 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKHQ9HCJ1 492 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD274Q9NZQ7 290 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 HCN3Q9P1Z3 774 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF112Q9ULX5 631 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 NFU1Q9UMS0 254 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC22A7Q9Y694 548 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 NBASA2RRP1 2371 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 IDSB3KWA1 339 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 SGK494L7N484 410 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 KERAO60938 352 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 RDH16O75452 317 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 IPO13O94829 963 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 C2P06681 752 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACPPP15309 386 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNAZP19086 355 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 AHRP35869 848 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSPA7P48741 367 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOX8P57073 446 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 TLE1Q04724 770 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYBPC3Q14896 1274 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 STAG3L4Q8TBR4 150 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC44A1Q8WWI5 657 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 ESAMQ96AP7 390 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 C8orf44Q96CB5 159 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 NXNL1Q96CM4 212 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATOH8Q96SQ7 321 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJC11Q9NVH1 559 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPRC5BQ9NZH0 403 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUDT4Q9NZJ9 180 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms