RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 CYP27C1Q4G0S4 372 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 FKBP1CQ5VVH2 108 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 TEX37Q96LM6 180 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 C12orf42Q96LP6 360 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 TAS2R16Q9NYV7 291 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 GLUD1P00367 558 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 C1QBP02746 253 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 TGFB3P10600 412 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 PRPS2P11908 318 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 LPOP22079 712 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
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PACS1-201ENST00000320580 MASP1P48740 699 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 ALDH9A1P49189 494 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 BCL2L1Q07817 233 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
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PACS1-201ENST00000320580 SLC22A15Q8IZD6 547 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 ESX1Q8N693 406 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 DNERQ8NFT8 737 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 COPS5Q92905 334 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 FKBP10Q96AY3 582 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 SENP8Q96LD8 212 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 DUSP21Q9H596 190 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 PDZD7Q9H5P4 517 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 GORASP2Q9H8Y8 452 aa16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 IRS2Q9Y4H2 1338 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 DCLK1O15075 740 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 STK16O75716 305 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 GPC1P35052 558 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.175e-11■■■■■ 37
PACS1-201ENST00000320580 DCST1Q5T197 706 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 CNIH2Q6PI25 160 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 TAC4Q86UU9 113 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 DPP10Q8N608 796 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 NPWQ8N729 165 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 DNAJB8Q8NHS0 232 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 PYCR2Q96C36 320 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 EVA1BQ9NVM1 165 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 SRRDQ9UH36 339 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 RETP07949 1114 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 HSPA14Q0VDF9 509 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 NTRK2Q16620 822 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 SYTL3Q4VX76 610 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 TRIM40Q6P9F5 258 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 IFNL1Q8IU54 200 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 SLITRK4Q8IW52 837 aa16.09■□□□□ 0.17
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PACS1-201ENST00000320580 PROKR1Q8TCW9 393 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 BTN2A2Q8WVV5 523 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 RFT1Q96AA3 541 aa16.09■□□□□ 0.17
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PACS1-201ENST00000320580 SLAMF7Q9NQ25 335 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 IFT46Q9NQC8 304 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 HCN1O60741 890 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 SLC10A3P09131 477 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 EPORP19235 508 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 DAPP51397 102 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 PJA1Q8NG27 643 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 OR8K5Q8NH50 307 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 ST6GAL2Q96JF0 529 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 ZNF583Q96ND8 569 aa16.09■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 SLC35F4A4IF30 521 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 TEX46H3BTG2 121 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 GMDSO60547 372 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 SERPIND1P05546 499 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 ZNF286BP0CG31 522 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 KCNC4Q03721 635 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 INCA1Q0VD86 236 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 ST8SIA4Q92187 359 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 KCNN1Q92952 543 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 NTAN1Q96AB6 310 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 NPY6RQ99463 290 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 FUZQ9BT04 418 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 C3orf14Q9HBI5 128 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 MCCC2Q9HCC0 563 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 RHCGQ9UBD6 479 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 FZD4Q9ULV1 537 aa16.08■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 CLDN9O95484 217 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 S1PR4O95977 384 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 HEPACAMQ14CZ8 416 aa16.08■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 DENND1CQ8IV53 801 aa16.08■□□□□ 0.16
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