RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC13A3Q8WWT9 602 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SELENOMQ8WWX9 145 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PYCR2Q96C36 320 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ACPTQ9BZG2 426 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 MOSPD1Q9UJG1 213 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SNX6Q9UNH7 406 aa15.28■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM202A6NGA9 273 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SLCO2B1O94956 709 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 FTH1P02794 183 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 FCGR1AP12314 374 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 MTPNP58546 118 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 NFATC4Q14934 902 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 TCEA2Q15560 299 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 MAPKAPK3Q16644 382 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 GGTA1PQ4G0N0 100 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SUSD1Q6UWL2 747 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ISLR2Q6UXK2 745 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 RD3Q7Z3Z2 195 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 DDHD1Q8NEL9 900 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 OR8J3Q8NGG0 315 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 BTN2A2Q8WVV5 523 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 GTF2H4Q92759 462 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 TEX101Q9BY14 249 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ELOVL6Q9H5J4 265 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF696Q9H7X3 374 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 VCX3AQ9NNX9 186 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 GPR27Q9NS67 375 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC22A14Q9Y267 594 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM186AA6NE01 2351 aa15.27■□□□□ 0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ARHGAP10A1A4S6 786 aa15.27■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 OR2AG2A6NM03 316 aa15.27■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 C4orf47A7E2U8 309 aa15.27■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 DFNA5O60443 496 aa15.27■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 SDC3O75056 442 aa15.27■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 CER1O95813 267 aa15.27■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 HTR1BP28222 390 aa15.27■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 NEK2P51955 445 aa15.27■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 RASGRP3Q8IV61 690 aa15.27■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 TBC1D21Q8IYX1 336 aa15.27■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 CBR4Q8N4T8 237 aa15.27■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 CLMPQ9H6B4 373 aa15.27■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM9BQ9NQ34 198 aa15.27■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 DNAJC11Q9NVH1 559 aa15.27■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 VAPAQ9P0L0 249 aa15.27■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 CIDEBQ9UHD4 219 aa15.27■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 KLF15Q9UIH9 416 aa15.27■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa15.27■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF292O60281 2723 aa15.27■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 PGRP06401 933 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 CCT8P50990 548 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ABRQ12979 859 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 BNIP3Q12983 259 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 NHSL2Q5HYW2 709 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 SPANXN4Q5MJ08 99 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 LDLRAP1Q5SW96 308 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 NLRP8Q86W28 1048 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 PARGQ86W56 976 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 PPP1R14BQ96C90 147 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 FBXL8Q96CD0 374 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 HIC2Q96JB3 615 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 NSMCE2Q96MF7 247 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 WDR92Q96MX6 357 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF583Q96ND8 569 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 OR52E6Q96RD3 313 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 C9orf16Q9BUW7 83 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 ATG10Q9H0Y0 220 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 CFAP54Q96N23 3096 aa15.26■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 KRT87PA6NCN2 255 aa15.25■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 QSOX1O00391 747 aa15.25■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 TOR1BO14657 336 aa15.25■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 PRAMEF4O60810 478 aa15.25■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 PGM3O95394 542 aa15.25■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 CLPTM1O96005 669 aa15.25■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
TSNARE1-201ENST00000307180 POLE2P56282 527 aa15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms