RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299022.9

LIPC-201, Transcript of lipase C, hepatic type, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIPC, Length 2,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPC-201ENST00000299022 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
LIPC-201ENST00000299022 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
LIPC-201ENST00000299022 TESMINQ9Y4I5 508 aa9.52□□□□□ -0.88
LIPC-201ENST00000299022 WASH3PC4AMC7 463 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 CCNDBP1O95273 360 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 ETFAP13804 333 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 PRPS1L1P21108 318 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 OPRL1P41146 370 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 PRSS53Q2L4Q9 553 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 GGTA1PQ4G0N0 100 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 DEPDC1Q5TB30 811 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 TMEM236Q5W0B7 351 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 HORMAD1Q86X24 394 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 SYTL1Q8IYJ3 562 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 FAR1Q8WVX9 515 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 MRGPRX3Q96LB0 322 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 KCNC2Q96PR1 638 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 HEPHQ9BQS7 1158 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 DUSP26Q9BV47 211 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 TDP1Q9NUW8 608 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 RLIMQ9NVW2 624 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 GPATCH2Q9NW75 528 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 GIN1Q9NXP7 522 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 TMEM9Q9P0T7 183 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 OGDHLQ9ULD0 1010 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 SLC6A14Q9UN76 642 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 ERVW-1Q9UQF0 538 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 TMEM229AB2RXF0 380 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 NPC1O15118 1278 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 FABP3P05413 133 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 POU2F1P14859 743 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 SYN1P17600 705 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 XPAP23025 273 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 VIPR1P32241 457 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 IDUAP35475 653 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 CRATP43155 626 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 MAGEA2P43356 314 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 CREMQ03060 361 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 MTAPQ13126 283 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 MAPK11Q15759 364 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 NPTX1Q15818 432 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 CTF1Q16619 201 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 RGS21Q2M5E4 152 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 SMU1Q2TAY7 513 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 CFAP206Q8IYR0 622 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 VN1R2Q8NFZ6 395 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 AP2M1Q96CW1 435 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 HHIPQ96QV1 700 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 WDR70Q9NW82 654 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 PSME2Q9UL46 239 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 ERGIC3Q9Y282 383 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 ORC6Q9Y5N6 252 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 GMPPBQ9Y5P6 360 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 SNX5Q9Y5X3 404 aa9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 J3KTA2 159 aa9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 SLCO2B1O94956 709 aa9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 MT-ND2P03891 347 aa9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 LCKP06239 509 aa9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 RHOP08100 348 aa9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 LINC00271P0C7V0 271 aa9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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LIPC-201ENST00000299022 S100A1P23297 94 aa9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 PSMB9P28065 219 aa9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 NCS1P62166 190 aa9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 HBA1P69905 142 aa9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 AHSA2Q719I0 299 aa9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 HIPK1Q86Z02 1210 aa9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 ZNF540Q8NDQ6 660 aa9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 WDR48Q8TAF3 677 aa9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 ZNF480Q8WV37 535 aa9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 MUL1Q969V5 352 aa9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 OR2AG1Q9H205 316 aa9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 KIF17Q9P2E2 1029 aa9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa9.51□□□□□ -0.89
LIPC-201ENST00000299022 CFAP99D6REC4 459 aa9.51□□□□□ -0.89
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