RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298317.8

RPUSD4-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-201ENST00000298317 PADI2Q9Y2J8 665 aa13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 DHRS7Q9Y394 339 aa13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 CMAHPQ9Y471 501 aa13.05□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 A0A1W2PQH9 124 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 OR5K3A6NET4 321 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 C2orf81A6NN90 581 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 H3BM21 787 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 H3BUI4 141 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 GUCA1CO95843 209 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 CCNYL3P0C7X3 344 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 PRPS2P11908 318 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 COL6A1P12109 1028 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 ENGP17813 658 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 CBLP22681 906 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 CPN2P22792 545 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 GDF5P43026 501 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 HOXC5Q00444 222 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP13.04□□□□□ -0.323e-6■□□□□ 8.9
RPUSD4-201ENST00000298317 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 LURAP1LQ8IV03 231 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 SLC5A8Q8N695 610 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 OR10G2Q8NGC3 310 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 GPR152Q8TDT2 470 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 DNAJB3Q8WWF6 145 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 TPD52L3Q96J77 140 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 TSSK3Q96PN8 268 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 KATNBL1Q9H079 304 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 P2RY12Q9H244 342 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 CPA4Q9UI42 421 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 MEN1O00255 615 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 TLR5O60602 858 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 SCG5P05408 212 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 TACR1P25103 407 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 SLC9A3P48764 834 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 ABRQ12979 859 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 VEZF1Q14119 521 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 BTBD16Q32M84 506 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 OVOS1Q6IE37 1185 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 RGMBQ6NW40 437 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 LRRTM3Q86VH5 581 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 MGME1Q9BQP7 344 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 CD244Q9BZW8 370 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 RLIMQ9NVW2 624 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 DUSP12Q9UNI6 340 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 OARD1Q9Y530 152 aa13.04□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 NLRC5Q86WI3 1866 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 MYO16Q9Y6X6 1858 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 LOC730098B7Z3J9 87 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 M0R129 80 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 TNFRSF11BO00300 401 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 SDC1P18827 310 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 ALAS2P22557 587 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 UQCRC1P31930 480 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 PTGER3P43115 390 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 DAB2P98082 770 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 MTAPQ13126 283 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 QPRTQ15274 297 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 TOR2AQ5JU69 321 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 SAXO2Q658L1 398 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 FBXL22Q6P050 247 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 PAMR1Q6UXH9 720 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 FAM9CQ8IZT9 166 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 SYNPOQ8N3V7 929 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 GDPD1Q8N9F7 314 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 OR4C15Q8NGM1 316 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 UBTD2Q8WUN7 234 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 SMIM14Q96QK8 99 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 SLC29A3Q9BZD2 475 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 UCKL1Q9NWZ5 548 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 MAT2BQ9NZL9 334 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 NUP50Q9UKX7 468 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 SH3D21A4FU49 640 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 TMEM229AB2RXF0 380 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 PLA2G10O15496 165 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 AKR7A2O43488 359 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 OR2B3O76000 313 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 EPN2O95208 641 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 CSF2P04141 144 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 SLC10A3P09131 477 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 ACADMP11310 421 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 ANXA8P13928 327 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 LPOP22079 712 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 TBX4P57082 545 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 DMC1Q14565 340 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 VEPH1Q14D04 833 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 GPR19Q15760 415 aa13.03□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 DUOXA1Q1HG43 343 aa13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms