RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 WNT3P56703 355 aa20.52■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ACSM2AQ08AH3 577 aa20.52■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ACSM2BQ68CK6 577 aa20.52■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 PROSER1Q86XN7 944 aa20.52■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 OR2T12Q8NG77 320 aa20.52■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 SEPHS2Q99611 448 aa20.52■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa20.52■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ERVK-11Q9UQG0 969 aa20.52■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 BTBD3Q9Y2F9 522 aa20.52■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 LRP4O75096 1905 aa20.51■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 A0A096LPI6 279 aa20.51■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 KLHL33A6NCF5 533 aa20.51■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 SOCS2O14508 198 aa20.51■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 DENRO43583 198 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 HSD3B1P14060 373 aa20.51■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 HSD3B2P26439 372 aa20.51■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 CTBSQ01459 385 aa20.51■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 MTAPQ13126 283 aa20.51■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 CYP2A13Q16696 494 aa20.51■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 UAP1L1Q3KQV9 507 aa20.51■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 LCTLQ6UWM7 567 aa20.51■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ISLR2Q6UXK2 745 aa20.51■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 Q6ZSR6 202 aa20.51■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 FAM20CQ8IXL6 584 aa20.51■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 TMEM145Q8NBT3 493 aa20.51■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 OR13H1Q8NG92 308 aa20.51■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 NSMCE2Q96MF7 247 aa20.51■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ANAPC2Q9UJX6 822 aa20.51■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 C10orf142B7Z368 130 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 SAP18O00422 153 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 AXIN1O15169 862 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 SCN2BO60939 215 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 SLC14A1Q13336 389 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 UGT2A3Q6UWM9 527 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 GPR180Q86V85 440 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 CHTF18Q8WVB6 975 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 SH3KBP1Q96B97 665 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ITCHQ96J02 903 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 RAB26Q9ULW5 256 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ARHGAP10A1A4S6 786 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ERN1O75460 977 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 RASGRP1O95267 797 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 TGFB1P01137 390 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 PRPS1L1P21108 318 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 AKT2P31751 481 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 RPE65Q16518 533 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 FAM9CQ8IZT9 166 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 FAM86B1Q8N7N1 296 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 TSTD1Q8NFU3 115 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ZNF597Q96LX8 424 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 GBP5Q96PP8 586 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 CENPKQ9BS16 269 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 EFCAB11Q9BUY7 163 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa20.5■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 FAM170BA6NMN3 283 aa20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 PDLIM1O00151 329 aa20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 KIR3DL1P43629 444 aa20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 GZMMP51124 257 aa20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 KRT33BQ14525 404 aa20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ARHGAP19Q14CB8 494 aa20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 MARVELD2Q8N4S9 558 aa20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 DEFB119Q8N690 84 aa20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 FIG4Q92562 907 aa20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 CCDC115Q96NT0 180 aa20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 HTR1BP28222 390 aa20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ALG11Q2TAA5 492 aa20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 HKDC1Q2TB90 917 aa20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 C17orf64Q86WR6 236 aa20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 LAS2Q8IYD9 372 aa20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 DEFB123Q8N688 67 aa20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 OR52E1Q8NGJ3 308 aa20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 OR51B5Q9H339 312 aa20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 RMND5AQ9H871 391 aa20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 INVSQ9Y283 1065 aa20.49■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 APBB3O95704 486 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 IGLV3-19P01714 112 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 GBAP04062 536 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ANXA6P08133 673 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 LAMP1P11279 417 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 COX7A2P14406 83 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 FASP25445 335 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 ZNF542PQ5EBM4 170 aa20.48■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 KIAA0895LQ68EN5 471 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms