RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 MRGPREQ86SM8 312 aa23.89■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 KCT2Q8NC54 265 aa23.89■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 OR9A4Q8NGU2 314 aa23.89■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 MIEF2Q96C03 454 aa23.89■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 IP6K3Q96PC2 410 aa23.89■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 SPSB2Q99619 263 aa23.89■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 SARGQ9BW04 601 aa23.89■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 TXLNGYQ9BZA5 131 aa23.89■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 ING2Q9H160 280 aa23.89■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 GPRC5BQ9NZH0 403 aa23.89■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 TUBD1Q9UJT1 453 aa23.89■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 CCDC88CQ9P219 2028 aa23.88■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 MKRN2OSH3BPM6 223 aa23.88■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 DNAJB5O75953 348 aa23.88■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 C1QL1O75973 258 aa23.88■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 CXCR2P25025 360 aa23.88■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 SCTRP47872 440 aa23.88■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 PDK4Q16654 411 aa23.88■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 RHEBL1Q8TAI7 183 aa23.88■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 STT3BQ8TCJ2 826 aa23.88■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 TRIM55Q9BYV6 548 aa23.88■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 CD244Q9BZW8 370 aa23.88■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 ANKHQ9HCJ1 492 aa23.88■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 ZFP69BQ9UJL9 534 aa23.88■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 ATMQ13315 3056 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 ESPNB1AK53 854 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 ZGLP1P0C6A0 271 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 IL1RNP18510 177 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 AHRP35869 848 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 CCL11P51671 97 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 RRADP55042 308 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 RGS1Q08116 209 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 C19orf57Q0VDD7 668 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 NFATC3Q12968 1075 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 PWP1Q13610 501 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 VWA2Q5GFL6 755 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 ATG9BQ674R7 924 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 MED25Q71SY5 747 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 ZNF843Q8N446 348 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 AMER3Q8N944 861 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 ISL2Q96A47 359 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 MOCOSQ96EN8 888 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 ABHD17AQ96GS6 310 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 CRB3Q9BUF7 120 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 SLC25A18Q9H1K4 315 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 CACNA1GO43497 2377 aa23.87■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 CCDC189A1A4V9 331 aa23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 VSTM2BA6NLU5 285 aa23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 NSA2O95478 260 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 GFAPP14136 432 aa23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 TNFRSF8P28908 595 aa23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 MAGEA12P43365 314 aa23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 AGTR2P50052 363 aa23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 KLC1Q07866 573 aa23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 SYT16Q17RD7 645 aa23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 PRSS41Q7RTY9 318 aa23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 KRT78Q8N1N4 520 aa23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 ANKRD53Q8N9V6 530 aa23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 TRPV3Q8NET8 790 aa23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 SCYL1Q96KG9 808 aa23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 P4HTMQ9NXG6 502 aa23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 OPTCQ9UBM4 332 aa23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 ASB1Q9Y576 335 aa23.86■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 H0YIG0 161 aa23.85■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 MMP11P24347 488 aa23.85■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 RBBP7Q16576 425 aa23.85■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 XKR6Q5GH73 641 aa23.85■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 NT5CQ8TCD5 201 aa23.85■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa23.85■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 GPR78Q96P69 363 aa23.85■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 CCDC77Q9BR77 488 aa23.85■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa23.85■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 SEMA3GQ9NS98 782 aa23.85■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 C14orf105Q9NVL8 296 aa23.85■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 ZNF358Q9NW07 568 aa23.85■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 C3orf18Q9UK00 162 aa23.85■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 SLC22A7Q9Y694 548 aa23.85■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa23.84■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 SGK494L7N484 410 aa23.84■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 MAP2K7O14733 419 aa23.84■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 SLU7O95391 586 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 IGHEP01854 428 aa23.84■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 MTHFD2P13995 350 aa23.84■■□□□ 1.41
PDF-201ENST00000288022 GCAP28676 217 aa23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms