RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 SLC30A2Q9BRI3 323 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PPW3 197 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 RPP38P78345 283 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 FAM189A2Q15884 450 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 REEP3Q6NUK4 255 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 DNM1P34Q6PK57 102 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CD180Q99467 661 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF20P17024 532 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 PRKACGP22612 351 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 EDNRAP25101 427 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 GSCP56915 257 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 RPS13P62277 151 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 PHC1P78364 1004 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF763Q0D2J5 394 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 PON3Q15166 354 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 GRHL3Q8TE85 626 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 GAL3ST1Q99999 423 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 KCNH6Q9H252 994 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 DIRAS1O95057 198 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 C4orf46Q504U0 113 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A16Q86VW1 577 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CMTM8Q8IZV2 173 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 POF1BQ8WVV4 589 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ADAM7Q9H2U9 754 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 FKBP14Q9NWM8 211 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 MTMR11A4FU01 709 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 OR6C70A6NIJ9 312 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CDRT1O95170 752 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 APLP1P51693 650 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CREB5Q02930 508 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 TECRLQ5HYJ1 363 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 SHISA4Q96DD7 197 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 SOCS5O75159 536 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 DIO3P55073 304 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 OR51B5Q9H339 312 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 C12orf4Q9NQ89 552 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 SERINC1Q9NRX5 453 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 GIMAP2Q9UG22 337 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 DFNA5O60443 496 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 F8A1P23610 371 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 TMBIM6P55061 237 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 BTN3A2P78410 334 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 OR9A1PQ8NGU1 263 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF461Q8TAF7 563 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 TSSK6Q9BXA6 273 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 GLDCP23378 1020 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 OR12D2P58182 307 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 DSG2Q14126 1118 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 AVL9Q8NBF6 648 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 DGAT2Q96PD7 388 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 Q9N2J8 555 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 BRD7Q9NPI1 651 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R43P59537 309 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 NIPAL1Q6NVV3 410 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 OR52E4Q8NGH9 312 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 SLC2A13Q96QE2 648 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 SLC6A15Q9H2J7 730 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0J9YVX5 310 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ALPPL2P10696 532 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 MEDAGQ5VYS4 303 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 XKR5Q6UX68 686 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF627Q7L945 461 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 NRSN1Q8IZ57 195 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 TDP1Q9NUW8 608 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 KMOO15229 486 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf47O95873 294 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 HTR1EP28566 365 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF615Q8N8J6 731 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 MMP27Q9H306 513 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 XPNPEP2O43895 674 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 GRIK2Q13002 908 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 MAB21L1Q13394 359 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A36Q96CQ1 311 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ABI3Q9P2A4 366 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 FZD9O00144 591 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 KAT7O95251 611 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms