RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 FRS2Q8WU20 508 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D20Q96BZ9 403 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ASF1AQ9Y294 204 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ZNF236Q9UL36 1845 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CLDN24A6NM45 220 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 K7ERQ8 282 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SLC28A2O43868 658 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 FZD6O60353 706 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CD1EP15812 388 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 GGT5P36269 586 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 BMXP51813 675 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 KCNC4Q03721 635 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 DOC2AQ14183 400 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 NDUFA9Q16795 377 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 GTDC1Q4AE62 458 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CFAP206Q8IYR0 622 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 DENND6BQ8NEG7 585 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 FLCNQ8NFG4 579 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 OR8J2Q8NGG1 315 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SLC5A11Q8WWX8 675 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 LYSMD1Q96S90 227 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ARMC7Q9H6L4 198 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MGAT4BQ9UQ53 548 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SPACA6W5XKT8 324 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MAPK12P53778 367 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TPRG1LQ5T0D9 272 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 GPR26Q8NDV2 337 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 OR52N2Q8NGI0 321 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 OR9A1PQ8NGU1 263 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TEX47Q8TBZ9 253 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SUSD6Q92537 303 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 LGALS12Q96DT0 336 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PIP5K1AQ99755 562 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 STOML2Q9UJZ1 356 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TOR1BO14657 336 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ABLIM3O94929 683 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 NR2F6P10588 404 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CD72P21854 359 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MAP2K4P45985 399 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 BDKRB1P46663 353 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 VBP1P61758 197 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 RPS13P62277 151 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 KLHL22Q53GT1 634 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ARSIQ5FYB1 569 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TRIQKQ629K1 86 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MZT2BQ6NZ67 158 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 UNC5DQ6UXZ4 953 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 DEF8Q6ZN54 512 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MTSS1LQ765P7 747 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TRIM74Q86UV6 250 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TRIM73Q86UV7 250 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TTLQ8NG68 377 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 NFKBIDQ8NI38 313 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TRIM63Q969Q1 353 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 NUS1Q96E22 293 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TRBC2A0A5B9 178 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ASPDHA6ND91 283 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 H3BNC9 293 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CCL16O15467 120 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 GKP32189 559 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 KHKP50053 298 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PPP2R2BQ00005 443 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 RGNQ15493 299 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 DEFB115Q30KQ5 88 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CST9Q5W186 159 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TAS1R1Q7RTX1 841 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 C11orf96Q7Z7L8 435 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 FAM46DQ8NEK8 389 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 UCK2Q9BZX2 261 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 RNF38Q9H0F5 515 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CALML5Q9NZT1 146 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SEC14L3Q9UDX4 400 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 USP22Q9UPT9 525 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TLR4O00206 839 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 KLKB1P03952 638 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PPP5CP53041 499 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 BNC1Q01954 994 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ZNF544Q6NX49 715 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TBPL2Q6SJ96 375 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SUSD1Q6UWL2 747 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZVU0 165 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa8.53□□□□□ -1.04
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