RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 VTCN1Q7Z7D3 282 aa15.99■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 TOMM5Q8N4H5 51 aa15.99■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 ALPK1Q96QP1 1244 aa15.99■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 BACE2Q9Y5Z0 518 aa15.99■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 WASF2Q9Y6W5 498 aa15.99■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 IRAK2O43187 625 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 PRPS1L1P21108 318 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 GPR88Q9GZN0 384 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 SLC7A11Q9UPY5 501 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 NIPSNAP2O75323 286 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 SEMA3AQ14563 771 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 CARD17Q5XLA6 110 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 OR5K1Q8NHB7 308 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 BTBD1Q9H0C5 482 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 C11orf49Q9H6J7 331 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 MAGEA11P43364 429 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 PLGLAQ15195 96 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 COMTD1Q86VU5 262 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 STOML3Q8TAV4 291 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 ITM2CQ9NQX7 267 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 TRIM64CA6NLI5 447 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 IFNGR1P15260 489 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 MAGEA3P43357 314 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 ADGRE1Q14246 886 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 XKRXQ6PP77 449 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 TAC4Q86UU9 113 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 KAZALD1Q96I82 304 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 CCM2Q9BSQ5 444 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 ARHGAP23Q9P227 1491 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 ANXA3P12429 323 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 MBLAC2Q68D91 279 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 C11orf98E9PRG8 122 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 ACOX3O15254 700 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 GBAP04062 536 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 SFTPBP07988 381 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 IRF9Q00978 393 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 SNX27Q96L92 541 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 TAC3Q9UHF0 121 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 UGT1A9O60656 530 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 UGT1A6P19224 532 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 UGT1A4P22310 534 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 GALNT15Q8N3T1 639 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 SLC32A1Q9H598 525 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 UGT1A7Q9HAW7 530 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 UGT1A10Q9HAW8 530 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 UGT1A8Q9HAW9 530 aa15.98■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 IRS2Q9Y4H2 1338 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 FARS2O95363 451 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 ALPIP09923 528 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 PRDX6P30041 224 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 SEC23BQ15437 767 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 SPOCK2Q92563 424 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 TMEM209Q96SK2 561 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 GIN1Q9NXP7 522 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 KNTC1P50748 2209 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 MLC1Q15049 377 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 NLGN2Q8NFZ4 835 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 PCDHB18PQ96TA0 734 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 DPAGT1Q9H3H5 408 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 CXorf21Q9HAI6 301 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 NLGN3Q9NZ94 848 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 HCN2Q9UL51 889 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 RCCD1A6NED2 376 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 GPR25O00155 361 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 MTX2O75431 263 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 LRIF1Q5T3J3 769 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 SCLYQ96I15 445 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 FUCA2Q9BTY2 467 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 LRRC3Q9BY71 257 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 PPM1BO75688 479 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 FOXR2Q6PJQ5 311 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 TIGD4Q8IY51 512 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 FAM86B1Q8N7N1 296 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 ROBO3Q96MS0 1386 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 CDH11P55287 796 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 RNF220Q5VTB9 566 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 TAMM41Q96BW9 452 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 TTTY10Q9BZA0 68 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 ICKQ9UPZ9 632 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 MMP20O60882 483 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 PET100P0DJ07 73 aa15.97■□□□□ 0.15
LAMC1-201ENST00000258341 VIPR1P32241 457 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms