RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 C16orf89Q6UX73 402 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 DSELQ8IZU8 1212 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 B3GNT4Q9C0J1 378 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 DCLRE1BQ9H816 532 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 UCK1Q9HA47 277 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 EFCAB1Q9HAE3 211 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 NDE1Q9NXR1 346 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 WWOXQ9NZC7 414 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 KLHL3Q9UH77 587 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 PDE10AQ9Y233 779 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 EFCAB7A8K855 629 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 K7EPI3 171 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 SLCO2B1O94956 709 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 VIPP01282 170 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 IDSP22304 550 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 GPX3P22352 226 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 GGT5P36269 586 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 PRLHRP49683 370 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 ACTR3P61158 418 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 DMPKQ09013 629 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 NFE2L1Q14494 772 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 C6orf163Q5TEZ5 329 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 GK5Q6ZS86 529 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 AMZ2Q86W34 360 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 FAM129CQ86XR2 697 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 VRK3Q8IV63 474 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 ASZ1Q8WWH4 475 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 TUBGCP3Q96CW5 907 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 IPPKQ9H8X2 491 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 PARVBQ9HBI1 364 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 SLC39A1Q9NY26 324 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 OPTCQ9UBM4 332 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
HOXC6-201ENST00000243108 ANXA5P08758 320 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 MTTPP55157 894 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 STX1BP61266 288 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 STX5Q13190 355 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 GPR18Q14330 331 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 AGKQ53H12 422 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 RNF165Q6ZSG1 346 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 SPATA19Q7Z5L4 167 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 PGAM4Q8N0Y7 254 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 TCAIMQ8N3R3 496 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 CDYL2Q8N8U2 506 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 OR4F6Q8NGB9 312 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 ELMO1Q92556 727 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 SEMA4CQ9C0C4 833 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 APMAPQ9HDC9 416 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 PSMD13Q9UNM6 376 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 L3MBTL1Q9Y468 752 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 B4E171 279 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 ERVH48-1M5A8F1 160 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 UBXN7O94888 489 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 MATN4O95460 622 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 C9P02748 559 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 TSPAN7P41732 249 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 PIK3CGP48736 1102 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 GSTA3Q16772 222 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM164Q5U3C3 297 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 TRIM48Q8IWZ4 208 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 FBXW8Q8N3Y1 598 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 RSC1A1Q92681 617 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 CDK15Q96Q40 435 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 CTRCQ99895 268 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 NTMT1Q9BV86 223 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 DDA1Q9BW61 102 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 TRIM54Q9BYV2 358 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 SPRY4Q9C004 299 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 GIMAP2Q9UG22 337 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 STK16O75716 305 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 PSMG1O95456 288 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 CAPN1P07384 714 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 CD82P27701 267 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 CCNG1P51959 295 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 PPP1CAP62136 330 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 RHDQ02161 417 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 RPE65Q16518 533 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 METRNLQ641Q3 311 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 FUNDC1Q8IVP5 155 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 HOMEZQ8IX15 550 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 AVL9Q8NBF6 648 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 OR2T11Q8NH01 316 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 METTL6Q8TCB7 284 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXC6-201ENST00000243108 NKD1Q969G9 470 aa16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms