RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243103.3

HOXC12-201, Transcript of homeobox C12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC12, Length 3,335 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12-201ENST00000243103 B3GNT7Q8NFL0 401 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 MYDGFQ969H8 173 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 RHBDF1Q96CC6 855 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 TNIP3Q96KP6 325 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 QRFPRQ96P65 431 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 GON7Q9BXV9 100 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 SLC39A8Q9C0K1 460 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 SLC22A5O76082 557 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 ALDH1A1P00352 501 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 ERVPABLB-1P60509 514 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 SPIBQ01892 262 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 INCA1Q0VD86 236 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 MAB21L1Q13394 359 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 OR4F3Q6IEY1 312 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 Q6ZSR9 355 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 LPCAT1Q8NF37 534 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 OR8K3Q8NH51 312 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 MYLPFQ96A32 169 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 LINGO1Q96FE5 620 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 PYURFQ96I23 114 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 HSH2DQ96JZ2 352 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 LATS2Q9NRM7 1088 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 SPASTQ9UBP0 616 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 MYADML2A6NDP7 307 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 SSNA1O43805 119 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ALPIP09923 528 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ACPPP15309 386 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ATF6P18850 670 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 KCNQ1P51787 676 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 CTBP2P56545 445 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 INSL4Q14641 139 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ARMC12Q5T9G4 340 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF549Q6P9A3 640 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 GPSM1Q86YR5 675 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 PIH1D2Q8WWB5 315 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF225Q9UK10 706 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 TRAV20A0A0B4J274 112 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ANXA9O76027 345 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 SERPINF2P08697 491 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 THPOP40225 353 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 CSKP41240 450 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 HCAR3P49019 387 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 SLC10A7Q0GE19 358 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF79Q15937 498 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 TAPT1Q6NXT6 567 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 TMEM81Q6P7N7 255 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 CILP2Q8IUL8 1156 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 SVOPLQ8N434 492 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 LRRC17Q8N6Y2 441 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF366Q8N895 744 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 RNF170Q96K19 258 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 SAP130Q9H0E3 1048 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 CFL2Q9Y281 166 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 J3KTA2 159 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 FABP3P05413 133 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 CSF3P09919 207 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 MTHFD2P13995 350 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 CD52P31358 61 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 SDC2P34741 201 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 FNTBP49356 437 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 PRKCDQ05655 676 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 CBLBQ13191 982 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 KLHL12Q53G59 568 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 BRAT1Q6PJG6 821 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 PAQR9Q6ZVX9 377 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 FAM9CQ8IZT9 166 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 SLC5A8Q8N695 610 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 OR4F6Q8NGB9 312 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 ANGPTL6Q8NI99 470 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 LINC00052Q96N35 136 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 BAIAP2Q9UQB8 552 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 HAS3O00219 553 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 CASKO14936 926 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 INPPL1O15357 1258 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 MMP3P08254 477 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXC12-201ENST00000243103 S100A3P33764 101 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms