RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A1W2PQ72	361 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599	CCL21	O00585	134 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599	TTI1	O43156	1089 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599	C8G	P07360	202 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599	IL1RN	P18510	177 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599	CCND1	P24385	295 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599	IMPA1	P29218	277 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599	XCR1	P46094	333 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599	EXT1	Q16394	746 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM205	Q6UW68	189 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599	ASPG	Q86U10	573 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599	PSMF1	Q92530	271 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC30A3	Q99726	388 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TARDBP-231	ENST00000639599	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM227A	F5H4B4	570 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	MAGEA6	P43360	314 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	SP140	Q13342	867 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF766	Q5HY98	468 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	RPTN	Q6XPR3	784 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC5A8	Q8N695	610 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	MCU	Q8NE86	351 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	CD200R1	Q8TD46	325 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	RELT	Q969Z4	430 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	SERPINB12	Q96P63	405 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	TAAR6	Q96RI8	345 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	CYTH2	Q99418	400 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	LPAR4	Q99677	370 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	GFY	I3L273	518 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	SGK494	L7N484	410 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	SERPIND1	P05546	499 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	CD46	P15529	392 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	TDGF1P3	P51864	188 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	MPP1	Q00013	466 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	ART3	Q13508	389 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	PPP1R7	Q15435	360 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	MEP1A	Q16819	746 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	ACER2	Q5QJU3	275 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	PBK	Q96KB5	322 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	HAUS8	Q9BT25	410 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	CHST11	Q9NPF2	352 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	NOTCH2	Q04721	2471 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	PCM1	Q15154	2024 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	FEZF1	A0PJY2	475 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	RDH16	O75452	317 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	COX6B1	P14854	86 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	PGAM1	P18669	254 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	IL10	P22301	178 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	JAK1	P23458	1154 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	BCL6	P41182	706 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	SMS	P52788	366 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	RGS1	Q08116	209 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	NAE1	Q13564	534 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	HERC3	Q15034	1050 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	NSDHL	Q15738	373 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TARDBP-231	ENST00000639599	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		13.87	□□□□□ -0.19

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