RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	TERB1	Q8NA31	727 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	ATL1	Q8WXF7	558 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	UBE2F	Q969M7	185 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	FOPNL	Q96NB1	174 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	GULP1	Q9UBP9	304 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152		J3QRK9	145 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	UGDH	O60701	494 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	BCL10	O95999	233 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	TIMP1	P01033	207 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	OPN1SW	P03999	348 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	TMBIM6	P55061	237 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	KCNC3	Q14003	757 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	TIFA	Q96CG3	184 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	OR2AG1	Q9H205	316 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152		H0YIV9	168 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	AXIN1	O15169	862 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	TGFB1	P01137	390 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	IL1RN	P18510	177 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	TNFRSF1B	P20333	461 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	HTR1B	P28222	390 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	HNF4A	P41235	474 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	PRLHR	P49683	370 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF77	Q15935	545 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	SPRED2	Q7Z698	418 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF480	Q8WV37	535 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	NPC1	O15118	1278 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	SLC16A6	O15403	523 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	EPCAM	P16422	314 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	MMP12	P39900	470 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	CRAT	P43155	626 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	MAP2K4	P45985	399 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	TBPL1	P62380	186 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	MC1R	Q01726	317 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	DGCR6	Q14129	220 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	RFX4	Q33E94	735 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	ERAP2	Q6P179	960 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	C12orf40	Q86WS4	652 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	NAGS	Q8N159	534 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	GLMN	Q92990	594 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	FCRL1	Q96LA6	429 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	OR51B5	Q9H339	312 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	RUBCNL	Q9H714	662 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	PSME2	Q9UL46	239 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		12.61	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	PCDH7	O60245	1069 aa		12.61	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	ACPP	P15309	386 aa		12.61	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	BMX	P51813	675 aa		12.61	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	MLLT10	P55197	1068 aa		12.61	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	12.61	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	DMC1	Q14565	340 aa		12.61	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	SPCS2	Q15005	226 aa		12.61	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		12.61	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	CBLL1	Q75N03	491 aa		12.61	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	DPPA4	Q7L190	304 aa		12.61	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		12.61	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		12.61	□□□□□ -0.39
BRF1-222	ENST00000635152	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		12.61	□□□□□ -0.39

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