RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620055.4

CCL4L2-215, Transcript of C-C motif chemokine ligand 4 like 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL4L2, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCL4L2-215	ENST00000620055		A0A1W2PQM1	296 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055		K7ERQ8	282 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	IKBKB	O14920	756 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CEP104	O60308	925 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CBX6	O95503	412 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SERPINC1	P01008	464 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CALCA	P01258	141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CLEC3B	P05452	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	FYN	P06241	537 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CHRNA3	P32297	505 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CCR10	P46092	362 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CCL7	P80098	99 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	STIM1	Q13586	685 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	STK38	Q15208	465 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	RPE65	Q16518	533 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	NEK5	Q6P3R8	708 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PARG	Q86W56	976 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	IQUB	Q8NA54	791 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	METTL6	Q8TCB7	284 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	AZIN2	Q96A70	460 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	TIGD1	Q96MW7	591 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	STRADB	Q9C0K7	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SPAST	Q9UBP0	616 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055		F5H5T6	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	FPGT	O14772	594 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SNAP91	O60641	907 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CCNDBP1	O95273	360 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	DDAH2	O95865	285 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	TUBB4A	P04350	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SRC	P12931	536 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	KRT13	P13646	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CERS1	P27544	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	RABIF	P47224	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PLK1	P53350	603 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	MLLT10	P55197	1068 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SULT2A1	Q06520	285 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	LRMP	Q12912	555 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	FOXF2	Q12947	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	RABEP1	Q15276	862 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PMF1	Q6P1K2	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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