RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 CCL21O00585 134 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 STATHP02808 62 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 HRH2P25021 359 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 IMPA1P29218 277 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 GPS1Q13098 491 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 CTBP1Q13363 440 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 LONRF1Q17RB8 773 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD22Q5VYY1 191 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 PLAG1Q6DJT9 500 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 LANCL3Q6ZV70 420 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 PRSS41Q7RTY9 318 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 SHISA5Q8N114 240 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 MOCOSQ96EN8 888 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 PCNX1Q96RV3 2341 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 A8MUI8 341 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 VPS41P49754 854 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 MINDY4Q4G0A6 757 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 H3F3CQ6NXT2 135 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 MTFR2Q6P444 385 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 MRGPRGQ86SM5 289 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 OR51Q1Q8NH59 317 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC68Q9H2F9 335 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 PKDREJQ9NTG1 2253 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 TACC2O95359 2948 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 SDR42E2A6NKP2 422 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 CEP104O60308 925 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 MLNP12872 115 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 PMP22Q01453 160 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 PTK6Q13882 451 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 BTBD16Q32M84 506 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF766Q5HY98 468 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 MFSD4BQ5TF39 518 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 CD200R1Q8TD46 325 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 MCOLN3Q8TDD5 553 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 GPR21Q99679 349 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 MACROD1Q9BQ69 325 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 OR2W5A6NFC9 320 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 KIF5CO60282 957 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 WISP2O76076 250 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 BCL6P41182 706 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 SLC1A2P43004 574 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 XCR1P46094 333 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 RBPJQ06330 500 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 ACER2Q5QJU3 275 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 RPTNQ6XPR3 784 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF662Q6ZS27 426 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 CPNE9Q8IYJ1 553 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 THAP11Q96EK4 314 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF354BQ96LW1 612 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 LZTFL1Q9NQ48 299 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 HCN3Q9P1Z3 774 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 COMMD10Q9Y6G5 202 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 AKAP9Q99996 3911 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 SGK494L7N484 410 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 IL1RNP18510 177 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 CXCR5P32302 372 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 TBPL1P62380 186 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 CSNK1G2P78368 415 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 FCRLBQ6BAA4 426 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD37Q7Z713 158 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 PCGF5Q86SE9 256 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 BEST3Q8N1M1 668 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 MCUQ8NE86 351 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 TM4SF19Q96DZ7 209 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 PCBD2Q9H0N5 130 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 CHST11Q9NPF2 352 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRF-216ENST00000617451 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 KRT14P02533 472 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 HTR1EP28566 365 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 AGTR2P50052 363 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 LMNTD2Q8IXW0 634 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 CAMKVQ8NCB2 501 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 SERPINB12Q96P63 405 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 KCNK13Q9HB14 408 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 SLC19A2O60779 497 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 PTGER4P35408 488 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 TUBA3CQ13748 450 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 EXT1Q16394 746 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 TTC27Q6P3X3 843 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 TUBA3EQ6PEY2 450 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 KCT2Q8NC54 265 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRF-216ENST00000617451 MDS2Q8NDY4 140 aa23.5■■□□□ 1.35
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