RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 PDE7BQ9NP56 450 aa19.58■□□□□ 0.73
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CTDP1-208ENST00000613122 C10orf71Q711Q0 1435 aa19.58■□□□□ 0.73
CTDP1-208ENST00000613122 DLX3O60479 287 aa19.58■□□□□ 0.73
CTDP1-208ENST00000613122 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
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CTDP1-208ENST00000613122 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa19.58■□□□□ 0.73
CTDP1-208ENST00000613122 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.73
CTDP1-208ENST00000613122 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.73
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CTDP1-208ENST00000613122 IL33O95760 270 aa19.58■□□□□ 0.72
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CTDP1-208ENST00000613122 TMEM198Q66K66 360 aa19.57■□□□□ 0.72
CTDP1-208ENST00000613122 PQLC3Q8N755 202 aa19.57■□□□□ 0.72
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CTDP1-208ENST00000613122 GIN1Q9NXP7 522 aa19.56■□□□□ 0.72
CTDP1-208ENST00000613122 PIAS3Q9Y6X2 628 aa19.56■□□□□ 0.72
CTDP1-208ENST00000613122 ST3GAL3Q11203 375 aa19.56■□□□□ 0.72
CTDP1-208ENST00000613122 TGFBIQ15582 683 aa19.56■□□□□ 0.72
CTDP1-208ENST00000613122 SCAMP4Q969E2 229 aa19.56■□□□□ 0.72
CTDP1-208ENST00000613122 PHF12Q96QT6 1004 aa19.56■□□□□ 0.72
CTDP1-208ENST00000613122 H7BY64 318 aa19.56■□□□□ 0.72
CTDP1-208ENST00000613122 AHCYL1O43865 530 aa19.56■□□□□ 0.72
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