RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592857.5

SLC25A39-216, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 3

Gene SLC25A39, Length 837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-216ENST00000592857 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 FBXL4Q9UKA2 621 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ERVK-10P10266 1014 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 IMPA1P29218 277 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 UQCRFS1P47985 274 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 NAB1Q13506 487 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ADGRD1Q6QNK2 874 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 PNPLA2Q96AD5 504 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 TLCD1Q96CP7 247 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 OR2A5Q96R48 311 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 NDNQ99608 321 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 TBK1Q9UHD2 729 aa20.11■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 DOCK10Q96BY6 2186 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ZNF839A8K0R7 811 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ALOX12BO75342 701 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 VPS26AO75436 327 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 EMP3P54852 163 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 MUM1Q2TAK8 710 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 PRMT9Q6P2P2 845 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 KIRREL2Q6UWL6 708 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 IGFL3Q6UXB1 125 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 CNTN4Q8IWV2 1026 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 CYP4X1Q8N118 509 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 CDKL2Q92772 493 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 MESP1Q9BRJ9 268 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ZNF304Q9HCX3 659 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 SLC17A6Q9P2U8 582 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 NAV2Q8IVL1 2488 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ZBTB14O43829 449 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 CCNDBP1O95273 360 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 INHBAP08476 426 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ABATP80404 500 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 RELAQ04206 551 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 HKDC1Q2TB90 917 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 SLC26A11Q86WA9 606 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 CSNK1A1LQ8N752 337 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 EFCAB3Q8N7B9 438 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 GALNT11Q8NCW6 608 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 STT3BQ8TCJ2 826 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ZFATQ9P243 1243 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ZNF180Q9UJW8 692 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 FAM155BO75949 473 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ALPPP05187 535 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 EZRP15311 586 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 CDKN2DP55273 166 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 KLC1Q07866 573 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 FAM26EQ8N5C1 309 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 OR11G2Q8NGC1 345 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 COL26A1Q96A83 441 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 CABS1Q96KC9 395 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 SLAMF7Q9NQ25 335 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 SEMA3GQ9NS98 782 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 ABCF3Q9NUQ8 709 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 IKBKGQ9Y6K9 419 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A39-216ENST00000592857 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa20.08■□□□□ 0.8
SLC25A39-216ENST00000592857 HAT1O14929 419 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-216ENST00000592857 P2RX6O15547 441 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-216ENST00000592857 VPS4BO75351 444 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-216ENST00000592857 AHSGP02765 367 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-216ENST00000592857 ZGLP1P0C6A0 271 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-216ENST00000592857 GNLYP22749 145 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-216ENST00000592857 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-216ENST00000592857 RBBP7Q16576 425 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-216ENST00000592857 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-216ENST00000592857 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-216ENST00000592857 PLD3Q8IV08 490 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-216ENST00000592857 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-216ENST00000592857 CRB3Q9BUF7 120 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-216ENST00000592857 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-216ENST00000592857 VPS4AQ9UN37 437 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-216ENST00000592857 PDE10AQ9Y233 779 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-216ENST00000592857 PSAT1Q9Y617 370 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-216ENST00000592857 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SLC25A39-216ENST00000592857 KLHL41O60662 606 aa20.06■□□□□ 0.8
SLC25A39-216ENST00000592857 IPO13O94829 963 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SLC25A39-216ENST00000592857 FBLP22087 321 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms